硫糖铝使用有诸多禁忌，对硫糖铝过敏者禁用；低磷血症、肾功能不全患者慎用；正在服用某些药物者需注意药物相互作用，如与喹诺酮类药物结合影响其吸收，与华法林影响其抗凝效果；孕妇及哺乳期妇女慎用。
一、对硫糖铝过敏者禁用
硫糖铝是一种胃黏膜保护剂，若患者对硫糖铝中的任何成分过敏，使用后可能会引发严重的过敏反应，如皮疹、瘙痒、呼吸困难、过敏性休克等，因此对硫糖铝过敏者绝对不能使用该药物。
二、低磷血症患者慎用
硫糖铝在胃肠道内会与磷结合，长期或大量使用可能会导致低磷血症。低磷血症可能会影响机体的能量代谢等多种生理功能，对于本身已有低磷血症的患者，使用硫糖铝需谨慎评估，因为可能会进一步加重低磷血症的情况。对于儿童患者，由于其处于生长发育阶段，磷的平衡更为重要，低磷血症可能会影响骨骼发育等，所以儿童使用时更要严格权衡利弊。
三、肾功能不全患者慎用
肾功能不全患者的肾脏排泄功能下降，硫糖铝在体内的代谢和排泄可能会受到影响，容易在体内蓄积，从而可能引发一些不良反应。而且肾功能不全患者本身可能存在电解质等内环境紊乱的情况，使用硫糖铝需要密切监测相关指标，谨慎使用以避免加重肾脏负担或导致其他不良后果。对于老年肾功能不全患者，其肾脏功能随年龄增长本身有所减退，更要注意硫糖铝使用的谨慎性。
四、正在服用某些药物者需注意药物相互作用
1.与喹诺酮类药物：硫糖铝可与喹诺酮类药物结合，影响喹诺酮类药物的吸收，从而降低其抗菌效果，所以若患者正在服用喹诺酮类药物，使用硫糖铝需间隔一定时间，一般建议间隔2-4小时。对于儿童患者，使用喹诺酮类药物本身就有严格限制，若同时需要使用硫糖铝，更要格外谨慎，遵循医生的专业指导来调整用药方案。
2.与华法林：硫糖铝可能会影响华法林的吸收，进而影响华法林的抗凝效果。所以正在服用华法林的患者使用硫糖铝时，需要密切监测凝血功能，根据情况调整华法林的剂量等。对于有心血管疾病等需要长期服用华法林的患者，在使用硫糖铝时要特别注意这种药物相互作用带来的影响。
五、孕妇及哺乳期妇女慎用
目前关于孕妇及哺乳期妇女使用硫糖铝的安全性研究相对有限。硫糖铝是否会通过胎盘或进入乳汁尚不清楚，为了避免可能对胎儿或婴儿产生未知的不良影响，孕妇及哺乳期妇女使用硫糖铝需谨慎，应在医生充分评估利弊后再决定是否使用。例如，孕妇在孕期胃肠道不适需要使用胃黏膜保护剂时，要综合考虑硫糖铝对胎儿的潜在影响，权衡是否选择其他相对更安全的治疗方式或药物。
