米诺地尔搽剂有局部和全身副作用，局部副作用包括皮肤刺激、接触性皮炎；全身副作用有心血管系统影响、非用药部位多毛症。特殊人群中儿童低龄不建议用，孕妇应避免，哺乳期妇女谨慎使用，有心血管疾病病史者需格外小心并告知医生病情。
皮肤刺激：是较为常见的局部副作用，表现为用药部位可能出现轻度的瘙痒、红肿、脱屑等情况。有研究显示，约有一定比例（如2%-5%左右）的使用者会出现不同程度的皮肤刺激症状，这可能与米诺地尔对皮肤血管的扩张作用以及对皮肤角质形成细胞等的影响有关，一般在用药初期较为多见，随着持续用药，部分患者可能会逐渐耐受，但也有部分患者症状会持续存在或加重。
接触性皮炎：少数患者可能对米诺地尔搽剂中的某些成分过敏，从而引发接触性皮炎，表现为用药部位皮肤红斑、丘疹、水疱，伴有明显瘙痒或灼热感等。其发生机制与机体的过敏反应有关，当免疫系统将米诺地尔搽剂中的特定成分识别为外来抗原时，会启动免疫应答，导致皮肤出现炎症反应。
全身副作用
心血管系统影响：虽然相对较少见，但米诺地尔搽剂可能会通过皮肤吸收进入血液循环，对心血管系统产生一定影响。可能导致心率加快，这是因为米诺地尔具有扩张血管的作用，机体为了维持血压稳定，会反射性地引起心率代偿性增快；也可能引起血压变化，部分患者可能出现血压轻度下降等情况。有研究监测显示，约有小于1%的使用者可能会出现心率相关的轻微变化，但一般在停药后可恢复。
多毛症（非用药部位）：理论上，由于米诺地尔的血管扩张等作用可能会影响全身毛发的生长情况，极少数情况下可能会导致非用药部位出现多毛的现象，但这种情况发生概率极低。
特殊人群使用米诺地尔搽剂需注意的情况
儿童
低龄儿童不建议使用米诺地尔搽剂，因为儿童的皮肤屏障功能相对不完善，药物吸收及代谢与成人有较大差异，使用米诺地尔搽剂可能会带来未知的风险，如药物经皮肤吸收后对儿童尚未发育成熟的心血管系统等产生不良影响，且目前针对儿童使用米诺地尔搽剂的安全性和有效性研究相对有限。
孕妇及哺乳期妇女
孕妇应避免使用米诺地尔搽剂，虽然目前关于米诺地尔通过皮肤吸收进入母体血液循环后对胎儿影响的直接研究证据相对有限，但从安全角度考虑，药物可能会有一定风险传递给胎儿。哺乳期妇女使用时也需谨慎，因为药物有可能通过乳汁传递给婴儿，虽然经皮肤吸收进入乳汁的量相对较少，但仍存在不确定因素，如需使用，应在医生指导下权衡利弊后谨慎决定。
有心血管疾病病史者
本身有心血管疾病病史的患者使用米诺地尔搽剂需格外小心。这类患者使用后出现心血管系统副作用的风险可能相对较高，如本身有心率失常、高血压控制不稳定等情况的患者，使用米诺地尔搽剂后可能会进一步加重心血管系统的负担或影响病情，所以在使用前应详细告知医生自身心血管疾病的病史及当前病情控制情况，由医生评估是否可以使用及使用过程中的监测要点等。
