儿童睡眠障碍的成因涉及生理发育、心理行为、环境、疾病及药物等多方面因素，不同年龄段儿童的主导因素存在差异。
生理发育因素。婴幼儿神经系统发育不完善，大脑皮层兴奋与抑制失衡，易出现入睡困难或夜间频繁惊醒；出牙期牙龈肿痛、生长痛等躯体不适会干扰睡眠连续性；青春期褪黑素分泌节律改变，生物钟紊乱导致入睡延迟或早醒。
心理行为因素。学龄期儿童因学业压力、社交焦虑（如同伴矛盾、师生关系紧张）产生睡前过度思考，引发入睡困难；长期依赖抱睡、安抚奶嘴等不良入睡习惯形成条件反射，脱离后难以自主入睡；噩梦或对黑暗、独处的恐惧可能导致夜间惊醒，形成睡眠恐惧循环。
环境与生活方式因素。作息不规律（如熬夜、周末昼夜颠倒）破坏生物钟稳定性；睡前接触电子产品（手机、平板等），蓝光抑制褪黑素分泌，同时游戏的刺激性内容使神经持续兴奋，延长入睡潜伏期；睡前过饱、饥饿或摄入咖啡因、高糖食物，会因胃肠不适或神经兴奋干扰睡眠。
疾病与躯体因素。腺样体或扁桃体肥大阻塞上呼吸道，引发睡眠呼吸暂停综合征，表现为打鼾、张口呼吸、呼吸暂停及夜间憋醒；过敏性鼻炎、哮喘发作时，鼻塞、喘息会干扰正常呼吸节奏，导致睡眠碎片化；胃食管反流、癫痫发作等疾病也会诱发夜间睡眠异常，需结合原发病治疗。
