沙棘汁副作用相对较少，但部分人群有情况：胃肠道敏感者过量饮可能致不适；极少数过敏者会过敏；孕妇饮用需谨慎，儿童要适量且成人监护，糖尿病患者因含糖分需咨询医生后谨慎选择。
胃肠道反应：对于一些胃肠道较为敏感的人群，过量饮用沙棘汁可能引起胃肠道不适，如胃部不适、腹胀、腹痛、腹泻等。这是因为沙棘汁中含有一定的有机酸等成分，过量摄入可能刺激胃肠道黏膜，改变胃肠道内环境，影响胃肠道正常的消化吸收功能。例如，有研究表明，当一次性大量摄入沙棘汁后，部分人群会出现明显的胃肠道蠕动加快等情况，进而导致腹泻等症状。
过敏反应：极少数对沙棘过敏的人群饮用沙棘汁后可能发生过敏反应，表现为皮肤瘙痒、皮疹、红斑，严重时可能出现呼吸困难、喉头水肿等严重过敏症状。这是因为过敏体质人群的免疫系统将沙棘汁中的某些成分识别为过敏原，从而引发免疫应答，释放组胺等活性物质，导致过敏症状的出现。例如，有过敏体质者饮用沙棘汁后迅速出现皮肤瘙痒并伴有红色皮疹，经临床诊断为沙棘过敏。
对特殊人群的影响
孕妇：目前关于孕妇饮用沙棘汁的安全性研究相对有限，虽然沙棘本身有一定的营养价值，但孕妇属于特殊人群，由于其生理状态的特殊性，饮用沙棘汁需谨慎。如果孕妇本身有胃肠道敏感等情况，饮用不当更易引发胃肠道不适，且其过敏风险也需关注，因为孕期身体的免疫状态可能发生变化，过敏反应的表现和严重程度可能与非孕期不同。
儿童：儿童的消化系统和免疫系统发育尚不完善，饮用沙棘汁时需注意适量。过量饮用可能导致儿童胃肠道功能紊乱，如出现腹痛、腹泻等。同时，儿童过敏风险也需考虑，一旦发生过敏反应，由于儿童的身体机能特点，可能比成人更难应对严重的过敏症状，所以儿童饮用沙棘汁应在成人监护下，且控制饮用量。
糖尿病患者：沙棘汁中一般含有一定糖分，糖尿病患者饮用后可能引起血糖波动。因为糖尿病患者的血糖调节功能异常，摄入糖分后身体不能像正常人那样有效调节血糖水平，可能导致血糖升高，不利于病情控制，所以糖尿病患者饮用沙棘汁前需咨询医生，根据自身血糖控制情况谨慎选择。
