食品添加剂可能引发过敏反应，儿童等更易出现且症状可能更严重；一些人工合成食品添加剂会影响神经系统功能，干扰内分泌系统，对儿童生长发育、女性男性内分泌有不利影响；长期大量摄入含多种食品添加剂的食品会增加肝肾负担损害其功能，本身有肝肾基础疾病者食用会加重病情。
可能引发过敏反应
食品添加剂中的某些成分，如防腐剂中的苯甲酸及其盐类、抗氧化剂中的叔丁基对苯二酚（TBHQ）等，可能会引发过敏反应。例如，有研究表明，部分对特定食品添加剂敏感的人群，摄入含有相关添加剂的食品后，会出现皮肤瘙痒、红肿、呼吸困难等过敏症状。对于儿童来说，由于其免疫系统尚未完全发育成熟，相对更容易对食品添加剂产生过敏反应，且过敏症状可能更为严重。一些患有先天性过敏体质的儿童，在食用含有致敏性食品添加剂的食物时，风险更高，需要特别注意食品标签中添加剂的成分标识。
影响神经系统功能
一些人工合成的食品添加剂可能对神经系统产生不良影响。比如，某些人工色素，如胭脂红、柠檬黄等，有研究发现长期大量摄入可能会干扰儿童的神经系统发育，导致注意力不集中、多动等问题。在成人中，长期过量摄入含有这类添加剂的食品，也可能影响神经系统的正常功能，导致记忆力下降、情绪波动等情况。对于长期处于高压工作状态的成年人，神经系统本就承受较大压力，再加上食品添加剂的不良影响，可能会进一步加重神经系统的负担。
对肝脏和肾脏造成损害
食品添加剂需要经过肝脏和肾脏的代谢和排泄，长期大量摄入含有多种食品添加剂的食品，会增加肝脏和肾脏的负担，可能对其功能造成损害。例如，一些防腐剂、人工色素等在体内代谢过程中会产生一些有毒物质，需要依靠肝脏的解毒功能和肾脏的排泄功能来处理，长期积累可能超出肝脏和肾脏的代偿能力。对于本身患有肝脏或肾脏基础疾病的人群，如慢性肝炎患者、慢性肾炎患者等，食用含有较多食品添加剂的食物会加重病情，影响疾病的治疗和康复。
干扰内分泌系统
部分食品添加剂具有类似激素的结构或作用，可能会干扰人体的内分泌系统。例如，一些人工合成的抗氧化剂、防腐剂等可能会影响激素的分泌和调节。这对于儿童的生长发育可能产生不利影响，因为儿童的内分泌系统尚在发育阶段，更容易受到外界因素的干扰。对于女性来说，内分泌系统的紊乱可能会导致月经不调、乳腺增生等问题；对于男性，可能会影响精子的质量和数量等。处于特殊生理时期的女性，如孕期、哺乳期的女性，其内分泌系统相对敏感，食用含有干扰内分泌系统的食品添加剂的食物风险更高，可能会通过胎盘或乳汁影响胎儿或婴儿的生长发育。
