肝结核主要由结核分枝杆菌感染肝脏引起，其病因有结核菌血行播散、邻近组织结核病灶直接蔓延、淋巴系统传播、肝脏隐匿结核病灶激活等。
1.结核菌血行播散
当身体其他部位存在结核病灶（如肺结核、肠结核等），结核菌可通过血液循环到达肝脏，在免疫力低下者（如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂者）中更易发生。这是肝结核最常见的感染途径。
2.邻近组织结核病灶直接蔓延
肝脏周围的组织或器官（如胆囊、肠道、膈下等）存在结核病变时，结核菌可直接侵犯肝脏，导致肝结核。这种情况在儿童中可能更为隐匿，但病情进展可能较快。
3.淋巴系统传播
肝门淋巴结等部位的结核病灶，结核菌可通过淋巴系统播散至肝脏，引发肝结核。有基础疾病或生活方式不健康（如长期大量吸烟、酗酒）的人群，淋巴播散导致肝结核的可能性增加。
4.肝脏隐匿结核病灶激活
部分患者既往可能有潜在的肝脏结核感染，因自身免疫力等因素，结核病灶处于隐匿状态。当机体免疫力下降时，隐匿的结核病灶可能被激活，发展为肝结核。
