氯霉素有血液系统反应可致骨髓抑制分可逆与不可逆、消化系统反应常见胃肠症状、神经系统反应可致多种症状、有过敏反应及长期用可致二重感染，不同人群受影响及需注意情况不同。
氯霉素可能引起骨髓抑制，这是其较为严重的不良反应之一。可表现为可逆性血细胞减少，如粒细胞和血小板减少等，一般与剂量和疗程有关，及时停药后可恢复；还可能出现不可逆的再生障碍性贫血，虽然发生率较低，但后果严重，其发生机制可能与氯霉素抑制骨髓造血干细胞的线粒体蛋白合成有关，可能涉及个体的遗传易感性等因素，儿童、老年人等特殊人群由于自身生理机能特点，相对更易受到骨髓抑制的影响，需密切监测血常规等指标。
消化系统反应
口服氯霉素时常见消化系统症状，如恶心、呕吐、腹泻、食欲减退等。这是因为氯霉素可刺激胃肠道黏膜，影响胃肠道的正常消化和蠕动功能，一般在用药过程中较为常见，多数人在用药初期可能出现此类反应，一般可通过调整用药时间（如饭后服药）等方式一定程度缓解，但对于本身有胃肠道基础疾病的患者，如胃溃疡、胃炎患者，可能会加重原有病情，需谨慎使用。
神经系统反应
氯霉素可引起周围神经炎、视神经炎、失眠、幻听、幻视等神经系统症状。周围神经炎表现为手足麻木、肢体疼痛等，可能与氯霉素干扰神经组织的代谢有关；神经系统症状的发生可能与药物剂量、用药时间以及个体的神经敏感性有关，儿童的神经系统尚在发育中，使用氯霉素时发生神经系统反应的风险可能相对更高，需关注儿童用药后的神经精神状态变化。
过敏反应
少数患者可出现皮疹、药物热、血管神经性水肿等过敏反应。过敏反应的发生是由于机体对氯霉素产生免疫应答，属于超敏反应。不同个体的过敏体质不同，过敏反应的严重程度也有差异，严重的过敏反应可能导致过敏性休克等危及生命的情况，在用药前需详细询问患者的药物过敏史，尤其是对氯霉素及其他同类药物的过敏情况，过敏体质者需格外警惕。
其他
长期应用氯霉素可引起二重感染，如真菌病（如白色念珠菌引起的口腔炎、肠炎等）、伪膜性肠炎等。这是由于氯霉素抑制了正常肠道菌群，破坏了肠道菌群的平衡，导致耐药菌过度繁殖。老年人、长期使用免疫抑制剂或有基础疾病导致免疫力低下的人群，发生二重感染的风险更高，需注意观察有无新的感染症状出现，必要时进行相关检查以明确是否发生二重感染。
