抗生素类药物包括青霉素类抑制细菌细胞壁合成用于外科感染用前需皮试、头孢菌素类分四代通过与青霉素结合蛋白结合阻碍细胞壁合成用于不同外科感染、大环内酯类抑制细菌蛋白质合成用于青霉素过敏感染等、氨基糖苷类抗革兰阴性杆菌但有耳肾毒性需监测、喹诺酮类抑制细菌DNA旋转酶阻碍复制18岁以下不建议用；抗真菌类药物有唑类抗真菌药包括咪唑类局部用和三唑类用于真菌感染等且注意肝功能、棘白菌素类用于侵袭性真菌感染抑制细胞壁葡聚糖合成；抗病毒类药物有核苷类似物如阿昔洛韦抑制病毒DNA合成特殊人群需权衡、非核苷类似物如更昔洛韦抑制巨细胞病毒但注意骨髓抑制等不良反应。
青霉素类：如青霉素G，对大多数革兰阳性球菌和杆菌、革兰阴性球菌等有抗菌作用，常用于溶血性链球菌、肺炎链球菌等引起的外科感染。其作用机制是抑制细菌细胞壁的合成，使细菌细胞破裂死亡。例如，对于敏感菌引起的浅表软组织感染，青霉素G有较好的疗效，但使用前需进行青霉素皮试，防止过敏反应。
头孢菌素类：根据抗菌谱、抗菌活性、对β-内酰胺酶的稳定性以及肾毒性的不同，分为四代。第一代头孢菌素如头孢唑林，对革兰阳性菌的抗菌作用较强，可用于轻度的皮肤软组织感染等；第二代头孢菌素如头孢呋辛，对革兰阳性菌和部分革兰阴性菌有效，可用于呼吸道、泌尿道等部位的外科感染；第三代头孢菌素如头孢曲松，对革兰阴性菌的抗菌活性更强，对厌氧菌也有一定作用，可用于较严重的腹腔感染、盆腔感染等；第四代头孢菌素如头孢吡肟，抗菌谱更广，对耐药菌的作用较好。此类药物通过与细菌细胞膜上的青霉素结合蛋白结合，阻碍细菌细胞壁的合成而发挥杀菌作用。
大环内酯类：如红霉素，对革兰阳性菌、部分革兰阴性菌及支原体等有抗菌活性，可用于青霉素过敏患者的感染，如轻度的皮肤软组织感染、呼吸道感染等。作用机制是抑制细菌蛋白质的合成。阿奇霉素也是常用的大环内酯类药物，半衰期较长，用药次数相对较少，在外科感染中可用于支原体、衣原体感染相关的外科情况。
氨基糖苷类：如庆大霉素，对革兰阴性杆菌有较强的抗菌作用，可用于严重的革兰阴性杆菌感染引起的外科感染，如腹腔感染伴有革兰阴性杆菌感染时。但此类药物有耳毒性和肾毒性，使用时需监测肾功能和听力，儿童、老年人等特殊人群更应谨慎，因为儿童的肾功能发育不全，老年人肾功能减退，更容易受到耳、肾毒性的影响。
喹诺酮类：如左氧氟沙星，对革兰阳性菌和革兰阴性菌均有较强的抗菌活性，可用于呼吸道、泌尿道、皮肤软组织等部位的外科感染。其作用机制是抑制细菌DNA旋转酶，阻碍DNA复制。但18岁以下未成年人由于可能影响软骨发育，一般不建议使用该类药物。
抗真菌类药物
唑类抗真菌药：
咪唑类：如酮康唑，口服可用于深部真菌感染，但由于其肝毒性等不良反应，现在更多用于局部外用治疗浅表真菌感染，如皮肤念珠菌感染等。
三唑类：如氟康唑，对念珠菌属等有较好的抗菌活性，可用于念珠菌引起的口腔、食管、腹腔等部位的感染，以及隐球菌感染等。其通过抑制真菌细胞色素P450依赖酶，抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响细胞膜的通透性而发挥抗真菌作用。对于免疫功能低下的患者，如长期使用广谱抗生素导致菌群失调引发真菌感染，氟康唑有一定的应用，但需注意其对肝功能的影响，在使用过程中应监测肝功能指标。
棘白菌素类：如卡泊芬净，主要用于治疗侵袭性念珠菌病、曲霉菌病等，对于难治性或不能耐受其他抗真菌药物的患者有一定疗效。其作用机制是抑制真菌细胞壁葡聚糖的合成，使真菌细胞壁合成障碍，导致真菌细胞死亡。
抗病毒类药物
核苷类似物：如阿昔洛韦，主要用于治疗单纯疱疹病毒、水痘-带状疱疹病毒等引起的感染，对于外科的疱疹病毒感染性疾病有一定作用。其在被病毒感染的细胞内被病毒胸苷激酶磷酸化，转化为三磷酸阿昔洛韦，抑制病毒DNA多聚酶，从而抑制病毒DNA的合成。对于新生儿等特殊人群，使用阿昔洛韦时需权衡利弊，因为新生儿的肝肾功能发育不完善，药物代谢可能受到影响。
非核苷类似物：如更昔洛韦，对巨细胞病毒有较强的抑制作用，可用于巨细胞病毒引起的外科感染相关情况，如器官移植后巨细胞病毒感染等。使用时同样要注意其骨髓抑制等不良反应，在儿童和老年人中使用需密切监测血常规等指标。
