肉疼的原因可从肌肉相关、神经系统相关、其他系统相关来分析。肌肉相关原因有运动过量致乳酸堆积、肌肉拉伤，还有多发性肌炎、肌营养不良症等肌肉疾病；神经系统相关原因包括神经受压（如颈椎病、腰椎间盘突出症）、神经病变（如糖尿病性神经病变、带状疱疹后神经痛）；其他系统相关原因有感染性疾病（如流感、莱姆病）、内分泌疾病（如甲状腺功能亢进症、甲状旁腺功能亢进症），不同原因导致肉疼的机制和表现各有不同。
一、肌肉相关原因导致的肉疼
（一）运动相关
1.运动过量：当进行超出身体负荷的运动时，如突然进行高强度的无氧运动，像长时间快速奔跑、大量深蹲等，肌肉会产生过多的乳酸堆积。乳酸是运动过程中肌肉无氧代谢的产物，堆积在肌肉中会刺激神经末梢，引起肉疼。一般这种情况在运动后的1-2天内较为明显，常见于平时缺乏运动突然增加运动量的人群，尤其在青少年群体中，因参与体育活动突然加大强度时易出现。
2.肌肉拉伤：在运动过程中，由于姿势不当、用力过猛等原因可能导致肌肉拉伤。例如在篮球运动中跳起抢篮板时肌肉被过度牵拉，或者在健身做俯卧撑时胸肌拉伤等。肌肉拉伤后局部会出现疼痛、肿胀，严重时可能有淤血，这是因为肌肉纤维受损，引发炎症反应和局部组织的损伤刺激神经导致疼痛，各年龄段都可能发生，运动爱好者相对更易出现。
（二）肌肉疾病
1.多发性肌炎：这是一种自身免疫性疾病，病因可能与自身免疫功能紊乱有关。主要表现为对称性的近端肌肉无力和疼痛，可累及四肢肌肉、颈部肌肉等。患者会感觉肌肉疼痛、发僵，活动后加重，常见于成人，女性发病略多于男性。发病机制是免疫系统错误地攻击肌肉组织，导致肌肉炎症损伤而出现疼痛等症状。
2.肌营养不良症：是一组遗传性肌肉变性疾病，不同类型有不同的遗传方式和发病特点。例如杜氏肌营养不良症多见于男孩，主要表现为进行性的肌肉无力和肌肉疼痛，随着病情进展，肌肉萎缩逐渐明显，儿童期即可发病，由于基因缺陷导致肌肉细胞结构和功能异常，引起肌肉的一系列病理改变和疼痛等症状。
二、神经系统相关原因导致的肉疼
（一）神经受压
1.颈椎病：当颈椎发生病变，如椎间盘突出、骨质增生等，可能压迫神经根。如果压迫到支配上肢肌肉的神经根，就会引起上肢相应肌肉的疼痛，同时可能伴有麻木、无力等症状。长期伏案工作、低头看手机等不良生活方式的人群易患颈椎病，中老年人相对更常见，但年轻人因不良生活习惯也可能发病，颈椎的病变刺激压迫神经，导致神经支配区域的肌肉出现疼痛感觉异常。
2.腰椎间盘突出症：腰椎间盘发生退变、突出等改变，压迫神经根时可引起下肢肌肉疼痛。例如突出的椎间盘压迫支配腿部肌肉的神经，会导致腿部相应肌肉出现疼痛、麻木等症状，长期从事重体力劳动、久坐久站的人群高发，各年龄段均可发病，腰椎的病变影响神经，进而引起所支配肌肉的疼痛反应。
（二）神经病变
1.糖尿病性神经病变：糖尿病患者如果血糖控制不佳，长期高血糖状态会损伤神经，引起神经病变。其中一种表现就是周围神经病变，可出现四肢肌肉的疼痛，通常为对称性的，下肢较为常见，还可能伴有感觉异常如麻木、刺痛等。多见于病程较长、血糖控制不理想的糖尿病患者，由于高血糖损害神经纤维，影响神经的正常功能，导致肌肉出现疼痛等不适。
2.带状疱疹后神经痛：在感染带状疱疹病毒后，即使皮疹消退，仍可能遗留神经痛，疼痛可累及相应神经支配区域的肌肉，出现肉疼的感觉。任何年龄都可能发生，尤其是免疫力较低的人群，如老年人等，病毒侵犯神经后，神经修复过程中可能出现异常放电等情况，导致持续的疼痛症状，影响肌肉感觉。
三、其他系统相关原因导致的肉疼
（一）感染性疾病
1.流感：由流感病毒引起的急性呼吸道传染病，除了有发热、咳嗽、流涕等呼吸道症状外，部分患者会出现全身肌肉疼痛，这是因为病毒感染人体后，引起全身的炎症反应，释放炎症介质，刺激神经末梢导致肌肉疼痛，各个年龄段均可感染流感，冬春季较为高发，病毒感染引发的全身炎症波及肌肉组织引起疼痛。
2.莱姆病：由伯氏疏螺旋体感染引起的自然疫源性疾病，主要通过蜱虫叮咬传播。患者早期可能出现局部皮肤红斑，随后可出现全身症状，包括肌肉疼痛、关节疼痛等。在蜱虫流行地区生活或有蜱虫叮咬史的人群需警惕，因螺旋体感染引起全身炎症反应，导致肌肉受累出现疼痛。
（二）内分泌疾病
1.甲状腺功能亢进症：甲状腺激素分泌过多，机体处于高代谢状态。患者可能出现肌肉无力、疼痛，尤其是近端肌肉，如肩部、臀部肌肉等。同时还伴有多汗、心慌、手抖等症状，多见于中青年女性，由于甲状腺激素过多影响肌肉的能量代谢等过程，导致肌肉出现功能异常和疼痛。
2.甲状旁腺功能亢进症：甲状旁腺激素分泌过多，可引起钙磷代谢紊乱。患者可能出现肌肉无力、疼痛，还可能伴有骨骼疼痛等表现，各年龄段均可发病，尤其是中老年人群，钙磷代谢异常影响肌肉的正常生理功能，导致肌肉出现疼痛不适。
