先兆流产的发生主要与胚胎染色体异常、母体内分泌失调、子宫结构异常、环境与生活方式及感染免疫因素相关，其中胚胎染色体异常是早期流产最常见原因，占50%-60%。
胚胎染色体异常：早期流产中50%-60%由胚胎染色体异常导致，包括数目异常（如三体）或结构异常（如染色体易位），多因配子形成时突变或父母染色体异常（如平衡易位）。年龄＞35岁孕妇风险显著增加，此类异常多为偶发，再次妊娠可恢复正常。
母体内分泌失调：包括黄体功能不全（孕酮不足，影响子宫内膜容受性）、甲状腺功能异常（甲亢或甲减）及糖尿病血糖控制不佳。黄体功能不全约占内分泌因素流产的10%-20%，需通过孕酮检测明确。30岁以上女性、肥胖或糖尿病史者风险更高，孕期需定期监测激素指标。
子宫解剖结构异常：如黏膜下子宫肌瘤（占据宫腔空间）、子宫畸形（纵隔子宫、双角子宫）及宫腔粘连，可影响胚胎着床环境。此类异常多通过超声或宫腔镜检查发现，孕前矫正手术（如肌瘤剔除）可降低风险。有宫腔手术史（如人流）者需警惕粘连，既往流产史增加发病概率。
环境与生活方式及感染免疫因素：接触有害物质（甲醛、重金属）、吸烟、酗酒、咖啡因过量等不良生活方式，或生殖道感染（支原体、衣原体）、TORCH感染（弓形虫、风疹病毒等），以及自身免疫性疾病（如抗磷脂综合征）或同种免疫异常。此类因素可通过孕前检查（感染筛查）、生活方式调整（戒烟限酒）降低风险，有不良习惯或反复流产史者需优先干预。
