黄体酮在孕期合理补充时，对胎儿的明确严重副作用罕见。但长期大剂量使用、个体过敏反应或特殊生理状态下，可能存在胎儿内分泌环境改变、罕见发育异常等潜在风险，需由医生结合具体情况评估使用必要性。
剂量相关的胎儿内分泌干扰
过量或长期使用黄体酮可能使胎儿暴露于高孕激素环境，理论上可能影响女性胎儿生殖器官发育，增加罕见的外生殖器形态异常风险。但临床研究表明，正常治疗剂量下胎儿孕激素水平未超出生理范围，此类风险发生率极低。
母体过敏间接影响胎儿
极少数情况下，孕妇对黄体酮过敏可能引发母体严重过敏反应，如过敏性休克，若未及时干预可能导致胎儿宫内缺氧。但此类过敏反应属于母体不良反应，并非药物直接对胎儿产生副作用，临床发生率极低。
不当使用掩盖胚胎异常
孕早期盲目使用黄体酮可能掩盖胚胎发育异常（如胎停育），延误诊断，间接影响后续妊娠评估。但这属于诊断延误风险，而非药物对胎儿的直接副作用，需在明确诊断后规范使用。
高危孕妇的额外风险
有血栓病史、严重肝病的孕妇使用黄体酮时，可能因母体代谢异常增加血栓风险，影响胎盘血流，间接导致胎儿缺氧或生长受限。此类人群需严格遵医嘱使用，并加强胎儿监护。
