蒙被综合征可致神经系统后遗症如智力发育迟缓、运动障碍、癫痫等因大脑缺氧致神经细胞受损且婴幼儿神经发育快易受影响，可致呼吸系统后遗症如慢性肺部疾病相关症状因肺部受损未完全恢复致通气换气障碍，还可致心血管系统后遗症如心律失常、心脏功能异常因心脏受缺氧等刺激且婴幼儿心血管系统不成熟易留后遗症。
一、神经系统相关后遗症
蒙被综合征若导致严重脑缺氧，可能引发神经系统后遗症。例如，长期缺氧会使脑细胞受损，影响大脑的正常发育与功能。轻者可能出现智力发育迟缓，表现为认知、学习能力较同龄儿童落后；重者可出现运动障碍，如肢体瘫痪、肌张力异常等，还可能引发癫痫，即脑部神经元异常放电导致的反复发作性抽搐等症状。这是因为大脑在缺氧状态下，神经细胞的结构和功能遭到破坏，影响了神经信号的正常传递和脑的正常生理活动，而婴幼儿神经系统处于快速发育阶段，更易受此类损伤影响。
二、呼吸系统相关后遗症
若蒙被综合征时呼吸系统受损严重，可能遗留慢性肺部疾病相关后遗症。比如，长时间的缺氧、二氧化碳潴留等情况可能损伤肺部的组织结构和功能，导致肺部通气和换气功能障碍，进而出现慢性咳嗽、喘息、活动后气促等症状，影响孩子的呼吸功能和生活质量，尤其在日后遭遇呼吸道感染等情况时，症状可能更易加重，这是由于肺部在急性期受损后未能完全恢复，留下了长期的病理基础。
三、心血管系统相关后遗症
蒙被综合征还可能对心血管系统造成影响，遗留相关后遗症。严重的缺氧和应激反应可能导致心律失常等心脏问题，即使急性期病情得到控制，日后仍可能出现心脏功能异常，表现为活动耐力下降、心慌等症状，这是因为心脏在缺氧等不良刺激下受到损伤，心脏的节律和收缩功能等受到影响，且婴幼儿心血管系统尚不成熟，恢复能力相对较弱，更易留下长期的心血管后遗症。
