中枢神经损伤会引发多种功能障碍，包括运动功能障碍（儿童大运动发育迟缓、成人肢体无力等）、感觉功能障碍（躯体感觉异常如减退或过敏、内脏感觉异常等）、反射异常（深反射亢进或减弱、浅反射减弱或消失）、肌张力异常（肌张力增高或降低）、平衡与协调功能障碍（站立不稳、步态异常等）以及认知与精神障碍（认知功能下降、出现精神障碍如情绪不稳定等）。
感觉功能障碍
躯体感觉：中枢神经损伤可能引起躯体感觉异常，常见的有感觉减退，即对痛觉、温度觉、触觉等的感知能力下降；也可能出现感觉过敏，对正常情况下不会引起疼痛等感觉的刺激产生强烈的感觉。以脑部损伤为例，如脑卒中患者，可能会出现患侧肢体的感觉减退或过敏，患者可能感觉不到患侧肢体的触碰，或者轻微触碰就感觉疼痛难忍。对于儿童中枢神经损伤，感觉功能障碍可能影响其对周围环境的感知，进而影响其行为和学习能力。
内脏感觉：中枢神经对内脏感觉也有调控作用，中枢神经损伤可能导致内脏感觉异常，比如出现内脏痛觉的改变等情况。
反射异常
深反射：中枢神经损伤时，深反射可能会出现亢进或减弱。例如，髌腱反射、跟腱反射等深反射，在中枢神经损伤后，若损伤部位在脊髓以上，可能会出现深反射亢进，表现为反射活动增强，反射弧的反应比正常情况更强烈；而如果损伤部位在脊髓，可能会出现深反射减弱或消失。对于不同年龄段的人群，深反射异常的表现可能有所不同，儿童由于神经系统发育尚未完全成熟，中枢神经损伤后反射异常的表现可能与成人有所差异。
浅反射：浅反射也可能出现异常，如腹壁反射、提睾反射等浅反射，中枢神经损伤时可能会减弱或消失。
肌张力异常
肌张力增高：中枢神经损伤可导致肌张力增高，表现为肌肉僵硬，被动活动肢体时阻力增大。常见于锥体系损伤，如脑血管病引起的偏瘫患者，患侧肢体常出现肌张力增高，呈痉挛状态。对于婴幼儿中枢神经损伤导致的肌张力增高，可能会影响其肢体的正常运动姿势和运动发育。
肌张力降低：中枢神经损伤也可能出现肌张力降低，表现为肌肉松弛，肌力减弱。例如，脊髓灰质炎患者可能会出现相应肌群的肌张力降低，导致肌肉无力，影响肢体的运动功能。
平衡与协调功能障碍
中枢神经是维持人体平衡和协调运动的重要结构，损伤后会出现平衡与协调功能障碍。患者可能表现为站立不稳、行走时步态异常（如蹒跚步态、共济失调步态等）、精细动作困难等。对于老年人中枢神经损伤，平衡与协调功能障碍可能增加其跌倒的风险，而儿童中枢神经损伤导致的平衡与协调功能障碍则会影响其日常活动和运动技能的发展。例如，小脑损伤的患者会出现明显的共济失调，表现为动作不协调、平衡能力差等。
认知与精神障碍
认知功能：中枢神经损伤可能影响认知功能，如注意力不集中、记忆力减退、学习能力下降等。对于脑外伤患者，可能会出现不同程度的认知障碍，包括对时间、空间的定向力障碍等。儿童中枢神经损伤后，认知功能障碍可能会影响其学业成绩和日常生活中的学习能力。
精神障碍：部分中枢神经损伤患者还可能出现精神障碍，如情绪不稳定、抑郁、焦虑等。例如，脑卒中后抑郁是较为常见的情况，患者可能会出现情绪低落、对事物缺乏兴趣等表现。
