碘缺乏会引发多种健康问题，包括导致地方性甲状腺肿，使儿童、青春期、妊娠期、哺乳期女性易患病；胎儿期或新生儿期严重碘缺乏会引起克汀病，影响胎儿神经系统等发育；存在亚临床碘缺乏病，虽无明显临床症状但有轻度甲状腺功能减退，影响儿童智力、生长发育及成人神经精神、生育功能等；还会影响儿童青少年生长发育，损害儿童期大脑发育致智力等受损，对女性生殖系统致月经不调等，对男性致精子质量数量受影响，备孕男女需保证足够碘摄入。
一、甲状腺肿
碘是合成甲状腺激素的重要原料，当机体碘缺乏时，甲状腺激素合成减少，通过负反馈调节促使垂体分泌促甲状腺激素（TSH）增多，刺激甲状腺滤泡上皮细胞增生肥大，导致甲状腺肿大，即地方性甲状腺肿。儿童处于生长发育阶段，对碘的需求大，若碘缺乏更易发生甲状腺肿，青春期、妊娠期、哺乳期的女性因生理需求增加，也是碘缺乏易致甲状腺肿的人群。
二、克汀病（呆小症）
胎儿期或新生儿期严重碘缺乏会引起克汀病。胎儿期缺碘会影响胎儿神经系统发育，导致婴儿出生后智力低下、聋哑、生长发育迟缓、身材矮小、骨龄落后等。孕妇碘摄入不足会使胎儿在母体内甲状腺激素合成不足，进而影响神经系统的正常分化和发育，这种情况在严重碘缺乏地区更为常见，且女性在妊娠期间对碘的需求增加，若未能及时补充易引发此问题。
三、亚临床碘缺乏病
虽然没有明显的临床甲状腺肿或克汀病表现，但存在轻度甲状腺功能减退，可影响儿童的智力发育、生长发育以及成人的神经精神功能和生育功能等。儿童亚临床碘缺乏可能表现为学习能力下降等；成人可能出现记忆力减退、情绪不稳定等情况，育龄女性碘缺乏可能影响胎儿的正常发育。
四、对生长发育的影响
除了克汀病相关的生长发育迟缓外，碘缺乏还会影响儿童青少年的身高、体重增长以及身体的正常代谢等。碘缺乏会使机体代谢率降低，能量消耗减少，可能导致儿童青少年体型偏胖但发育不良等情况，且在身体的各个器官系统发育过程中，碘缺乏都会产生不利影响，如影响骨骼的正常生长和成熟等。
五、对智力发育的影响
在儿童期，尤其是胎儿期、婴儿期和儿童早期，是大脑发育的关键时期，碘缺乏会损害神经系统的发育，导致智力低下、学习能力和认知功能受损等。即使是轻度的碘缺乏也可能对儿童的智力产生长期的不良影响，这种影响可能在儿童的学习成绩、解决问题能力等方面体现出来，并且这种损害往往是不可逆的，所以保证孕期、哺乳期及儿童期的碘摄入至关重要。
六、对生殖系统的影响
对于女性，碘缺乏可导致月经不调、受孕困难等，还会影响胎儿的正常发育；男性碘缺乏可影响精子的质量和数量等。在育龄期，无论是男性还是女性，碘缺乏都会对生殖功能产生不良影响，进而影响生育后代的质量，所以备孕阶段的男女都需要保证足够的碘摄入来维持正常的生殖功能。
