清热化毒丸主要用于缓解小儿热毒炽盛所致的口舌生疮、咽喉肿痛、牙龈肿痛、痄腮（流行性腮腺炎）、小儿疮疖等症状，适用于3~12岁儿童，成人若症状相符也可在医生指导下使用。
对于小儿热毒炽盛引起的口舌生疮，表现为口腔黏膜充血、溃疡疼痛，影响进食，需注意保持口腔清洁，避免刺激性食物。咽喉肿痛症状常伴随扁桃体红肿、吞咽不适，需观察体温变化，体温超过38.5℃时，优先考虑物理降温或及时就医。牙龈肿痛可能伴随牙齿周围红肿，需注意口腔卫生，避免过硬食物刺激。
痄腮（流行性腮腺炎）症状表现为单侧或双侧腮腺肿大、疼痛，咀嚼时加重，需隔离休息，避免传染，饮食以清淡流质为主。小儿疮疖表现为皮肤局部红肿热痛的小疖肿，避免挤压，以防感染扩散，若疖肿较大或化脓，需及时就医。
特殊人群方面，婴幼儿（尤其是3岁以下）应避免自行使用，需在医生指导下用药；孕妇、哺乳期女性及对成分过敏者禁用；脾胃虚寒者慎用，可能出现腹泻等不适。用药期间需观察症状变化，若用药3天无改善或加重，应及时就医。
