长期适量服用左旋肉碱一般对健康人群无明显危害，但长期过量服用可能增加胃肠道不适、代谢紊乱风险。特殊人群需谨慎使用。
健康人群在合理剂量（通常每日补充不超过2克）范围内服用左旋肉碱，多数研究未发现长期服用会导致严重不良反应，常见副作用多为轻微胃肠道不适。但长期超量使用可能影响体内氨基酸代谢平衡，增加肝肾代谢负担，尤其对肝肾功能不全者可能加重器官损伤。
孕妇及哺乳期女性需在医生指导下使用，因缺乏长期安全性数据。老年人若存在基础代谢疾病，长期服用需监测肝肾功能指标，避免与其他代谢类药物叠加使用。
儿童及青少年不建议常规服用，其生长发育阶段更依赖均衡饮食与科学运动，非医疗需求下补充左旋肉碱可能干扰自然代谢过程。
心脑血管疾病患者长期服用时，需注意其对凝血功能的潜在影响，避免与抗凝血药物同时使用，建议定期咨询专业医师调整方案。
