男子精子畸形率高怀孕后，宝宝能否保留需结合畸形率程度及其他因素判断。若畸形率未超过96%（WHO第五版标准），且无其他严重异常，宝宝通常可正常发育。
1.轻度畸形率（90%~96%）：多数情况下，精子畸形率在90%~96%时，自然受孕后胎儿异常风险与正常精子受孕无显著差异。此类情况无需过度担忧，建议孕期加强产检，监测胎儿发育指标。
2.中重度畸形率（＞96%）：若精子畸形率超过96%，需排查是否存在遗传因素或染色体异常。建议夫妻双方进行染色体检查，若未发现异常，胎儿发育异常风险仍较低，但需在孕期中通过超声、唐筛等手段密切监测。
3.合并其他异常：若精子畸形率高同时伴随弱精、少精或染色体异常，可能增加胚胎发育异常风险。此类情况建议通过辅助生殖技术（如ICSI）筛选健康精子，降低风险。
4.特殊人群注意事项：高龄男性（＞40岁）、长期吸烟酗酒者、接触有害物质者，精子畸形率升高伴随胎儿异常风险可能增加，需提前咨询生殖科医生，孕期加强产检频率。
综上，精子畸形率高并非绝对禁止生育，但需结合具体情况评估，通过科学产检和必要干预措施保障母婴健康。
