幽门螺杆菌感染后存在复发可能，根除治疗后1年内复发率约0~10%，长期随访中复发风险随时间增加，尤其与治疗不彻底、再次感染或不良生活习惯相关。
治疗不彻底导致的复发：若首次根除治疗方案选择不当或疗程不足，细菌未被完全清除，停药后易再次活跃。例如，四联疗法中质子泵抑制剂剂量不足或疗程仅7天，会降低根除率，增加复发概率。
再次感染导致的复发：幽门螺杆菌通过口-口、粪-口途径传播，家庭内共同用餐、共用餐具等习惯易导致重复感染。尤其在卫生条件差的环境中，家庭成员间复发率显著升高。
特殊人群复发风险：老年人因胃黏膜萎缩、免疫力下降，复发率相对较高；糖尿病患者因血糖控制不佳影响胃黏膜修复，复发风险增加。此外，长期服用非甾体抗炎药的患者，胃黏膜保护不足，也可能诱发复发。
生活方式与复发关联：吸烟、酗酒会削弱胃黏膜屏障功能，增加幽门螺杆菌定植风险；高盐饮食、饮食不规律也可能促进细菌繁殖，导致复发。建议患者治疗后保持清淡饮食，戒烟限酒，规律作息。
降低复发的关键措施：治疗后需复查确认根除效果，若未成功需重新规范治疗；家庭成员应共同筛查，避免交叉感染；改善生活习惯，减少复发诱因。
