自身免疫性脑炎后遗症主要包括认知功能障碍（如记忆力减退、注意力不集中）、运动功能异常（如肢体无力、震颤）、精神行为改变（如情绪波动、幻觉）及癫痫发作等，部分患者可能遗留长期神经功能缺损。
认知功能障碍
表现为记忆力下降，尤其是近事记忆减退，难以学习新信息；注意力分散，完成复杂任务时易出错；部分患者出现执行功能障碍，如计划、组织能力下降。儿童患者可能表现为学习成绩下滑、语言表达能力受限。
运动功能异常
常见肢体无力，以肢体远端或近端肌肉受累为主，严重时出现行走困难；部分患者出现不自主运动，如震颤、舞蹈样动作；吞咽困难可能导致误吸风险，影响营养摄入。老年患者跌倒风险增加，需注意平衡训练。
精神行为改变
情绪波动明显，表现为焦虑、抑郁或易激惹；部分患者出现幻觉、妄想等精神症状；睡眠障碍（如入睡困难、早醒）影响生活质量。青少年患者可能出现社交退缩、学习兴趣丧失。
癫痫发作
约1/3患者在疾病后期出现癫痫，发作类型多样，包括全身性强直-阵挛发作、部分性发作等。长期癫痫发作可能加重认知损害，需规范抗癫痫治疗。
特殊人群注意事项
儿童患者若未及时干预，可能影响智力发育和学业发展，需尽早进行康复训练；老年患者因基础疾病多，康复周期较长，需家属协助日常护理；孕妇患者需密切监测病情变化，避免药物对胎儿影响。
