脑积水可由多种因素导致，包括脑脊液循环相关异常（如脑脊液产生过多的脉络丛乳头状瘤等、脑脊液吸收障碍的脑膜炎等）、脑室系统梗阻（先天性的先天性导水管狭窄、后天性的颅内肿瘤等）以及其他因素（早产儿、低体重儿、有神经系统疾病病史者等易引发脑积水）。
脑脊液吸收障碍：脑膜炎是常见的导致脑脊液吸收障碍的原因，脑膜炎时，蛛网膜颗粒等结构可能因炎症粘连等原因，影响脑脊液的正常吸收，使得脑脊液在脑室系统内积聚。例如，结核性脑膜炎患者，炎症刺激可导致蛛网膜颗粒堵塞，引起脑脊液吸收障碍，进而引发脑积水。此外，颅内出血后血液进入蛛网膜下腔等情况，也可能造成脑脊液吸收通道受阻，导致脑积水。
脑室系统梗阻引起脑积水
先天性梗阻：先天性导水管狭窄是较为常见的先天性脑室系统梗阻原因。胎儿在发育过程中，导水管发育异常，如狭窄、分叉等，使得脑脊液从第三脑室流入第四脑室的通道受阻，脑脊液在脑室系统内积聚，引起脑积水。这种情况在新生儿脑积水病因中占一定比例。
后天性梗阻：颅内肿瘤是后天性脑室系统梗阻的重要原因，如松果体区肿瘤、脑室系统内的肿瘤等，肿瘤可直接阻塞脑室系统的通道，导致脑脊液循环不畅。例如，室管膜瘤等肿瘤生长在脑室系统内，会堵塞脑室孔道，引起梗阻性脑积水。此外，颅内出血形成的血肿、颅脑外伤后的瘢痕组织等也可能导致脑室系统梗阻，引发脑积水。
其他因素相关脑积水
早产儿：早产儿由于脑发育尚未成熟，脑室周围的室管膜下存在生发基质，容易发生出血，而出血可能导致脑室系统梗阻，从而引发脑积水。早产儿脑积水的发生率相对较高，这与早产儿脑的生理特点密切相关。
低体重儿：低体重儿整体身体各系统发育相对不成熟，包括神经系统，其发生脑积水的风险可能与脑的发育不完善、容易出现脑脊液循环相关异常等因素有关。
有神经系统疾病病史者：既往有脑膜炎、颅内出血等神经系统疾病病史的人群，再次发生脑积水的风险增加。例如，曾经患过严重脑膜炎的患者，由于炎症导致的蛛网膜颗粒粘连等情况可能复发，进而引起脑积水；有颅内出血病史的患者，血液吸收不良等情况可能反复出现，导致脑室系统梗阻再次发生。
