手足口病病原学主要为肠道病毒科柯萨奇病毒A组（如A16型）及肠道病毒71型（EV71），少数由其他肠道病毒引发。
柯萨奇病毒A组16型
柯萨奇病毒A组16型是手足口病最常见病原体，约占流行病例的40%~50%，多见于学龄前儿童，尤其3岁以下婴幼儿易感。该病毒通过粪-口途径传播，感染后可引发手、足、口腔等部位皮疹及发热症状。
肠道病毒71型
肠道病毒71型致病力较强，约占重症病例的80%以上，可导致神经系统并发症（如无菌性脑膜炎、脑炎），甚至心肺功能衰竭。5岁以下儿童为高危人群，尤其2岁以内婴幼儿风险更高，需密切监测病情变化。
其他肠道病毒
埃可病毒、柯萨奇病毒A组其他亚型（如A6、A10）及柯萨奇病毒B组等也可引发手足口病，症状相对较轻，较少出现重症，但仍需与其他病毒感染鉴别。
病毒传播特点
病毒通过接触感染者的分泌物、疱疹液或污染的手、物品传播，传染性极强，在托幼机构等集体单位易暴发流行。感染后患者在病程1~2周内具有传染性，恢复期仍可能排毒，需做好隔离防护。
特殊人群注意事项
婴幼儿：2岁以下儿童是重症高发群体，需避免前往人群密集场所，家长应每日观察口腔、手足有无皮疹，发现高热不退、精神萎靡等症状及时就医。
免疫低下者：患有基础疾病（如糖尿病、先天性心脏病）或正在接受免疫抑制剂治疗的人群，感染后病情可能更严重，需提前做好防护。
