宝宝神经系统发育迟缓考虑与营养不良、苯丙酮尿症、地方性呆小病等因素有关，应针对病因进行治疗，具体如下：
1、营养不良
如果宝宝平时挑食或者偏食，导致体内摄入的营养成分较少，不能满足身体所需，则会造成神经系统发育迟缓。
家长应调整宝宝饮食结构，饮食方面可以吃些高蛋白、高维生素的食物，比如鸡肉、河虾、鱼肉、鸡蛋、奶制品、青菜、芹菜、苹果、草莓等，能够补充身体所需的营养物质，改善神经系统发育迟缓的现象。若病情较为严重，家长需及时带宝宝就医治疗，防止影响后续生活质量。
2、苯丙酮尿症
苯丙酮尿症属于常染色体隐性遗传病，可导致体内苯丙氨酸增高，影响中枢神经系统发育，引起神经系统发育迟缓。
临床上并没有特效药物可以治疗苯丙酮尿症，主要是通过低苯丙氨酸饮食疗法控制疾病发展。如果饮食疗法效果不佳，也可以考虑给予四氢生物蝶呤、左旋多巴等药物进行治疗。本病在早期干预的情况下，通常预后良好，宝宝的生长发育可能会逐渐达到正常标准。
3、地方性呆小病
若母亲孕期饮食中缺碘或者地方水中含钙过高，可导致胎儿缺乏足够的碘，使体内甲状腺素合成不足，出生后会出现地方性呆小病，影响神经系统发育，进而会出现神经系统发育迟缓的现象。
家长可以在医生的指导下给宝宝服用甲状腺片、左甲状腺素钠片等药物治疗，以改善临床症状。平时也可以给宝宝吃些海带、紫菜等含碘高的食物，对控制病情有好处。地方性呆小病在确诊后需要尽快处理，争取获得良好预后。
