新生儿总咳嗽可能是生理因素引起的，也可能是上呼吸道感染、新生儿肺炎等病理因素导致的，具体情况如下：
一、生理因素
周围环境温度过低，新生儿吸入冷空气后，可对咽喉黏膜产生刺激，出现总是咳嗽的现象。这种情况属于生理现象，无需进行特殊治疗，家长做好新生儿保暖工作，一段时间后咳嗽症状可缓解。
二、病理因素
1、上呼吸道感染
新生儿体内各个器官尚未发育完善，身体免疫力较弱，容易受到病毒、细菌等病原体侵袭，出现上呼吸道感染，表现为经常咳嗽、流鼻涕、发热等。大多数上呼吸道感染具有自限性，预后一般良好。
2、新生儿肺炎
新生儿吸入胎粪、羊水、奶液等异物，或者感染细菌、病毒等病原体，可出现肺炎。该病可使肺部炎性分泌物增多，对支气管产生刺激，引起咳嗽症状。新生儿肺炎随着病情进展，可并发肺动脉高压、呼吸衰竭等，所以建议及时就医治疗。
除了上述常见原因外，其他因素也可造成该现象，比如肺结核、脑炎、肺水肿等。家长可以带新生儿去医院完善相关的检查，比如体格检查、血常规、肺功能检查等，并及时针对病因进行治疗，以免耽误病情。
