怀孕45天药流有可能能流干净，但不能保证百分百干净。
1.药流的效果因人而异。虽然怀孕45天处于药流的适用时间范围内，但不同个体对药物的反应存在差异。有些孕妇可能对药物较为敏感，能较为顺利地排出孕囊等组织，达到相对干净的效果；而有的孕妇可能反应不明显，导致部分组织残留。
2.孕囊的大小和位置也会影响药流的结果。如果孕囊过大或位置特殊，可能会增加药流不完全的风险。
3.药流后观察很重要。在药流过程中及结束后，需要密切观察出血情况、腹痛等表现。如果出血过多、持续时间过长或伴有剧烈腹痛等异常，往往提示可能存在残留等问题。
4.后续检查不可少。即使药流后出血等情况看似正常，也需要进行超声等检查，以明确宫腔内是否还有残留组织。如果发现残留，可能需要进一步采取清宫等措施来处理。
总之，怀孕45天药流有流干净的可能，但存在不确定性，必须严格遵循医生的指导进行操作，并做好后续的观察和检查。一旦出现异常情况，应及时就医处理，以避免发生不良后果。
