肛门口疼痛的原因包括肛裂、肛窦炎、肛周脓肿、外痔、内痔、肛管直肠癌、肛门直肠神经官能症及其他因素，如肛门损伤、感染等。
1.肛裂
肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，是一种常见的肛管疾病，好发于青壮年，儿童也可发生，老年人较少。肛裂常发于肛门后、前正中，以肛门后部居多，在两侧的较少。初起仅在肛管皮肤上有一小裂口，有时可裂到皮下组织或直至括约肌浅层，裂口呈线形或棱形，如将肛门张开，裂口的创面即成圆形或椭圆形。肛裂多为单发的纵形、椭园形溃疡，反复损伤、感染，使基底较硬，肉芽灰白，裂下端皮肤因炎症、浅静脉及淋巴回流受阻，发生水肿，形成结缔组织性外痔，称“前哨痔”。肛裂上端肛乳头因炎症和纤维变，成肥大乳头。肛裂早期如果得不到及时治疗，会出现肛管溃疡、肛乳头肥大、哨兵痔等三种病症，继续发展还可出现肛窦炎和肛瘘，与前三症合称“肛裂五特征”。
2.肛窦炎
肛窦炎是指肛门齿线部的肛隐窝炎症性病变。肛窦炎常引起肛周脓肿等肛门感染性疾病。肛窦炎是化脓性细菌感染引起的肛隐窝炎症，多发生于20-40岁的青壮年。
3.肛周脓肿
肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿，称为肛管、直肠周围脓肿。其特点是自行破溃，或在手术切开引流后常形成肛瘘。是常见的肛管直肠疾病，也是肛管、直肠炎症病理过程的急性期，肛瘘是慢性期。常见的致病菌有大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌和绿脓杆菌，偶有厌氧性细菌和结核杆菌，常是多种病菌混合感染，肛门周围皮下脓肿最常见，多由肛腺感染经外括约肌皮下部向外或直接向外扩散而成。
4.外痔
外痔位于齿线以下，是由痔外静脉丛曲张或肛缘皱襞皮肤发炎、肥大、结缔组织增生或血栓瘀滞而形成的肿块。外痔表面盖以皮肤，可以看见，不能送入肛内，不易出血，以疼痛和有异物感为主要症状。临床常分为结缔组织外痔、静脉曲张性外痔、炎性外痔和血栓外痔。
5.内痔
内痔是长在肛门管起始处的痔，如果膨胀的静脉位于更下方，几乎是在肛管口上，这种曲张的静脉就叫外痔。内痔是位于肛门齿线以上，无肛管皮肤所覆盖由粘膜下痔内静脉丛扩大曲张所形成柔软的静脉团。根据内痔的症状，也有学者将其分为三期
Ⅰ期，无痛苦，主要以便血、分泌物多、痒为主；Ⅱ期，有便血，痔随排便脱垂，但能自行还纳；Ⅲ期（又称为晚期），内痔脱垂于肛门口外，或每次排便脱出肛门口外，不能自行还纳，必须用手托回。内痔好发于截石位3、7、11点处，又称为母痔；其他部位发生的痔，则称为子痔。
6.肛管直肠癌
肛管直肠癌破溃感染也会引起肛门肿痛。
7.肛门直肠神经官能症
阴部神经症候群、直肠炎症等均可引起肛门直肠疼痛。
8.其他
如肛门损伤、肛门周围皮肤感染等也会引起肛门疼痛。
如果出现肛门口疼痛，建议及时就医，明确原因，以便进行针对性治疗。同时，在日常生活中，要注意保持肛门清洁，避免长时间久坐，避免食用辛辣刺激性食物等。
