跑完步膝盖两侧疼，可能是以下原因引起：
1.运动过度：如果跑步距离过长、速度过快或强度过大，可能导致膝盖承受过多压力，引起疼痛。
2.肌肉疲劳：跑步时，腿部肌肉频繁收缩，容易出现疲劳和酸痛。如果肌肉力量不足，也可能导致膝盖两侧受力增加，引起疼痛。
3.姿势不正确：不正确的跑步姿势可能使膝盖承受不正常的压力，导致疼痛。
4.半月板损伤：半月板是位于膝盖内部的软骨结构，可能因跑步时的扭转或挤压而受伤，引起疼痛。
5.髌股关节综合征：髌股关节是膝盖前方的关节，过度使用或受伤可能导致炎症，引起疼痛。
6.髂胫束综合征：这条带状的肌肉经过膝盖外侧，当其紧张或受伤时，可能引起膝盖外侧疼痛。
针对跑步后膝盖两侧疼的情况，可以采取以下措施：
1.休息：停止跑步，给膝盖足够的时间恢复。
2.冷敷：用冰袋或冷毛巾敷在疼痛部位，每次15-20分钟，每天数次，有助于减轻炎症和疼痛。
3.按摩：轻轻按摩疼痛部位，缓解肌肉紧张。
4.拉伸：进行腿部肌肉的拉伸运动，增强肌肉柔韧性。
5.适当调整跑步计划：减少跑步距离和速度，增加休息时间，让身体逐渐适应。
6.强化腿部肌肉：通过力量训练增强腿部肌肉，提高膝盖的稳定性。
7.注意姿势：保持正确的跑步姿势，身体微微前倾，利用重力推动前进，避免过度跨步。
8.使用支撑性装备：如髌骨带或压缩裤，提供额外的支撑和保护。
9.就医：如果疼痛持续不缓解或加重，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定具体原因并接受相应的治疗。
对于经常跑步或有膝盖问题的人群，以下建议可能有助于预防疼痛的发生：
1.热身和冷却：在跑步前进行充分的热身活动，跑步后进行拉伸，帮助预防肌肉拉伤和膝盖受伤。
2.逐渐增加跑步强度：避免突然增加跑步的难度或距离，给身体足够的时间适应。
3.选择合适的跑鞋：跑鞋应提供良好的支撑和缓冲，减少对膝盖的冲击。
4.保持健康的体重：过重会增加膝盖的负担，导致更容易受伤。
5.定期进行康复训练：包括膝盖的强化训练和平衡训练，提高膝盖的健康水平。
6.注意休息：给身体足够的时间恢复，避免连续高强度跑步。
需要注意的是，每个人的身体状况和疼痛原因可能不同，如果疼痛持续或加重，或者伴随其他症状，如肿胀、红肿、活动受限等，应及时咨询医生或专业的运动医学专家的建议。早期诊断和治疗可以帮助避免问题的进一步恶化，并促进更快的康复。
