再生障碍性贫血的形态学改变主要体现在骨髓和外周血两方面。
一.骨髓形态学改变
1.骨髓增生程度
骨髓增生明显减低，造血细胞数量明显减少，骨髓腔内以脂肪细胞为主，造血细胞比例明显下降。
2.粒细胞系统
各阶段粒细胞明显减少，且比例失调，出现成熟障碍现象。
3.红细胞系统
红系细胞数量明显减少，形态大致正常，偶见早期红系细胞，显示红细胞生成受到抑制。
4.巨核细胞系统
巨核细胞数量明显减少甚至消失，血小板生成减少，导致出血倾向。
5.非造血细胞
淋巴细胞比例相对增多，但形态正常；浆细胞、组织嗜碱细胞等非造血细胞相对增多；骨髓小粒中脂肪滴增多，反映了骨髓基质的变化。
二.外周血形态学改变
1.红细胞
红细胞计数减少，血红蛋白浓度降低，但红细胞的平均体积、红细胞平均血红蛋白含量以及红细胞的平均血红蛋白浓度往往正常，表现为正细胞正色素性贫血。偶尔可见大红细胞，但一般没有嗜多色性红细胞的出现。
2.白细胞
白细胞总数明显降低，低于正常值（如4×109/L），在白细胞分类中，中性粒细胞减少尤为明显，一般低于0.5×109/L（重型再障）或稍高于此值（非重型再障），而淋巴细胞比例相对增高，可达到60%以上，甚至90%以上。
3.血小板
血小板计数明显降低，一般低于100×109/L，重型再障患者可能低于20×109/L。
