莫匹罗星软膏对祛痘有一定效果，但不能完全根治，且并非对所有痘痘都适用。
莫匹罗星软膏主要成分具有抗菌功效，能抑制金黄色葡萄球菌等与痘痘相关的细菌，减轻炎症反应，对红肿、有脓包的炎性痘痘效果较好，可缓解症状、促使痘痘消退。然而，痘痘成因复杂，除细菌感染外，还与皮脂腺分泌旺盛、毛囊口角化异常、内分泌失调等因素有关。对于闭合性粉刺等非细菌感染引起的痘痘，莫匹罗星软膏可能并不适用。
使用时需注意局部清洁，避免污染药膏，且不能过度依赖，长期大面积使用可能会导致耐药性产生，还可能引起局部皮肤瘙痒、发红等不适反应。
