原发性肝癌的诊断涉及血液学、影像学及病理学检查。血液学检查中甲胎蛋白等肿瘤标志物可辅助判断；超声是筛查首选，CT和MRI可进一步明确病变；肝穿刺活检是确诊金标准但有风险。
一、血液学检查
1.甲胎蛋白（AFP）：是诊断原发性肝癌的重要指标之一，在血清中AFP浓度升高对原发性肝癌的诊断有相对较高的特异性，约70%的原发性肝癌患者AFP水平会升高，但需要注意妊娠、活动性肝病等情况也可能导致AFP轻度升高，其意义在于辅助判断是否存在原发性肝癌的可能性以及评估病情变化等，对于高危人群（如有乙肝、丙肝病史，长期饮酒等）定期监测AFP有助于早期发现肝癌。
2.其他肿瘤标志物：如异常凝血酶原（PIVKA-Ⅱ），在原发性肝癌患者中也常升高，对原发性肝癌的诊断有一定辅助价值，联合AFP检测可提高诊断的准确性；血清岩藻糖苷酶（AFU）等也可作为辅助诊断指标，但特异性和敏感性相对AFP等有一定差异。
二、影像学检查
1.超声检查：是原发性肝癌筛查的常用首选方法，具有操作简便、价格低廉、可重复性强等优点。超声可发现肝脏内直径1cm左右的占位性病变，能初步判断病变的部位、大小、形态及血流情况等，可用于观察肝脏的形态结构、有无占位及血流情况，对肝癌的初步筛查和随访有重要意义，对于有乙肝等基础疾病的人群可定期通过超声检查监测肝脏状况。
2.计算机断层扫描（CT）：CT平扫及增强扫描对原发性肝癌的诊断价值较高，能够清楚地显示肝癌的大小、数目、形态、部位、边界、有无包膜侵犯以及肝内转移等情况，增强扫描时肝癌病灶多表现为“快进快出”的强化特点，有助于明确诊断和进行肿瘤分期等，对于超声发现的可疑病变可进一步通过CT检查明确诊断。
3.磁共振成像（MRI）：对原发性肝癌的诊断价值与CT相仿，且在显示肿瘤内部结构、与血管的关系等方面可能优于CT，尤其是对于小于1cm的肝癌病灶以及血管侵犯的显示更具优势，对于一些不适合做增强CT检查（如对碘对比剂过敏等）的患者可选择MRI检查来明确肝脏病变情况。
三、病理学检查
1.肝穿刺活检：在超声或CT引导下进行肝穿刺活检，可获取肝脏组织进行病理检查，这是确诊原发性肝癌的金标准。对于经过影像学检查怀疑肝癌但又不能明确诊断的患者，可通过肝穿刺活检明确病变性质，但该检查属于有创检查，存在一定的出血、种植转移等风险，需要严格掌握适应证，如患者凝血功能严重异常等情况则不宜进行。病理检查可以明确肿瘤的组织学类型等，为制定治疗方案提供重要依据。
