疱疹性咽峡炎由肠道病毒引起，最常见病原体是柯萨奇病毒A组（如A1A6、A8、A10等型）和肠道病毒71型（EV71）。柯萨奇病毒A组属小RNA病毒科肠道病毒属，经粪口、呼吸道飞沫传播，致咽峡部疱疹、溃疡等并伴发热；EV71传染性较强，可致严重并发症，婴幼儿易感染，人员密集等环境中感染几率高，有病史或密切接触者再感染风险高。
疱疹性咽峡炎是由肠道病毒引起的以急性发热和咽峡部疱疹、溃疡为特征的疾病。其中，最常见的病原体是柯萨奇病毒A组，例如柯萨奇病毒A1A6、A8、A10等型别较为常见；另外，肠道病毒71型（EV71）也可引起疱疹性咽峡炎。
柯萨奇病毒A组
柯萨奇病毒A组属于小RNA病毒科肠道病毒属。该病毒具有一定的传染性，主要通过粪口途径传播，也可通过呼吸道飞沫传播。在人群中，尤其是儿童群体中容易引起感染。柯萨奇病毒A组感染人体后，会在咽部等局部组织增殖，引发炎症反应，导致咽峡部出现疱疹、溃疡等典型的临床表现，同时可伴有发热等全身症状。
肠道病毒71型（EV71）
肠道病毒71型同样属于肠道病毒属。它的传染性相对较强，在疱疹性咽峡炎的病例中也较为常见。EV71感染人体后，除了可能引起咽峡部的疱疹、溃疡以及发热等症状外，部分患儿还可能出现比较严重的并发症，如手足口病等相关的神经系统、呼吸系统等方面的病变。对于儿童来说，由于其免疫力相对较低，感染EV71后发生重症的风险相对较高。在年龄方面，婴幼儿更容易受到肠道病毒71型的侵袭，因为他们的免疫系统发育尚不完善。在生活方式方面，如果儿童处于人员密集、卫生条件相对较差的环境中，感染肠道病毒71型的几率会增加。对于有疱疹性咽峡炎病史或者密切接触过相关患者的儿童群体，需要更加密切地关注，因为他们再次感染肠道病毒71型的风险可能会高于一般儿童。
