直肠脱垂的治疗分为非手术治疗和手术治疗。非手术治疗包括一般治疗（适用于儿童直肠脱垂及体弱年老患者）和注射治疗（适用于儿童不完全性直肠脱垂，成人完全性直肠脱垂复发率高）；手术治疗有经腹手术（如直肠悬吊固定术、直肠前切除术）、经会阴手术（如肛门环缩术、直肠黏膜环切术）、腹腔镜手术（创伤小、恢复快，适合身体状况较好的患者）。
一、非手术治疗
1.一般治疗：适用于儿童直肠脱垂及体弱年老患者。儿童直肠脱垂多可自愈，故以纠正便秘、养成良好排便习惯等一般治疗为主，如缩短排便时间，便后立即将脱出直肠复位，取俯卧位等；年老体弱患者需加强营养，治疗咳嗽、便秘等可增高腹压的疾病。
2.注射治疗：将硬化剂注射到脱垂部位的黏膜下层内，使黏膜与肌层产生无菌性炎症，粘连固定。常用硬化剂有5%石炭酸植物油、5%盐酸奎宁尿素水溶液等。该方法适用于儿童不完全性直肠脱垂，但成人完全性直肠脱垂注射治疗复发率较高。
二、手术治疗
1.经腹手术
直肠悬吊固定术：通过将直肠悬吊固定于骶骨前筋膜等部位，增强直肠的固定。适用于成人完全性直肠脱垂，尤其是伴有盆底松弛和直肠黏膜脱垂的患者。手术需在腹部进行操作，对手术者的技术要求较高，需充分考虑患者的全身状况及盆底结构等因素。
直肠前切除术：适用于直肠乙状结肠过长导致的脱垂，通过切除过长的直肠乙状结肠来缓解脱垂症状。手术需要考虑患者的肠道功能及术后肠道恢复等情况，尤其要关注老年患者肠道蠕动较慢等问题对术后恢复的影响。
2.经会阴手术
肛门环缩术：用金属线或涤纶带等环绕肛门，使肛门缩小以阻止直肠脱垂。适用于老年体弱或伴严重心、肺疾病不能耐受经腹手术者。对于女性患者，需考虑手术对盆底及生殖系统可能产生的影响，操作时要注意避免损伤周围组织。
直肠黏膜环切术：适用于直肠黏膜脱垂为主的患者，通过切除多余的直肠黏膜来改善脱垂情况。手术过程中要严格控制切除范围，防止出现出血、感染等并发症，同时要根据患者的年龄、身体状况等调整手术方案。
3.腹腔镜手术：是一种微创手术方式，具有创伤小、恢复快等优点。通过腹腔镜进行直肠脱垂的手术操作，如直肠悬吊等，对于患者的机体损伤相对较小，尤其适合身体状况相对较好、能耐受腹腔镜手术的患者，在考虑不同年龄患者的耐受程度时需综合评估。
