女性急性肾盂肾炎主要由细菌感染引起，最常见致病菌是大肠埃希菌等。感染途径有上行感染和血行感染，上行感染与女性尿道短宽直、接近肛门、特殊生理时期（月经期、妊娠期）及尿道局部用不透气卫生用品、有损伤等因素有关；血行感染是身体其他部位感染病灶细菌经血液循环达肾脏，糖尿病等基础疾病患者及新生儿、婴儿易发生。
一、感染途径-上行感染
1.生理结构因素
女性尿道短、宽且直，长度约3-5cm，相较于男性尿道，更接近肛门，肛门周围的细菌容易侵入尿道。例如，女性在性生活时，可能会将肛门周围的细菌挤压到尿道开口处，从而引发感染。而且女性尿道外口与阴道口、肛门相邻，会阴部的污染机会较多。在年龄方面，育龄期女性由于性生活相对频繁，更容易发生上行感染。
女性在月经期、妊娠期等特殊生理时期，机体的抵抗力会发生变化。月经期时，子宫内膜脱落，子宫颈口开放，为细菌侵入提供了便利条件；妊娠期时，增大的子宫会压迫输尿管，导致尿液引流不畅，也增加了细菌感染的风险。
2.尿道局部因素
长期使用卫生护垫等不透气的卫生用品，会使会阴部局部温度和湿度升高，有利于细菌的滋生繁殖。另外，尿道局部有损伤（如性生活导致的轻微损伤等），也会使细菌更容易侵入并上行感染至肾盂。
二、血行感染
1.全身感染时细菌播散
当身体其他部位有感染病灶时，细菌可通过血液循环到达肾脏引起肾盂肾炎。例如，皮肤感染（如痈、疖等）、肺部感染（如肺炎）等，细菌可随着血流到达肾脏。在病史方面，如果患者有糖尿病等基础疾病，机体抵抗力下降，更容易发生血行感染导致肾盂肾炎。糖尿病患者由于血糖水平高，有利于细菌生长繁殖，且机体的免疫功能也会受到影响，使得细菌更容易通过血行播散到肾脏引发感染。
新生儿和婴儿的血行感染相对较多见，因为他们的免疫系统发育尚不完善，身体其他部位的轻微感染容易通过血行扩散到肾脏。
