儿童隐匿性肾小球肾炎病因复杂，与感染（包括链球菌及其他细菌、病毒感染）、免疫（自身免疫紊乱、免疫复合物沉积）、遗传因素及其他因素（过敏、劳累）相关，感染可致免疫复合物沉积引发炎症，免疫因素有自身免疫紊乱和免疫复合物沉积，部分与遗传易感性有关，过敏、劳累等也可诱发。
感染因素：
链球菌感染：上呼吸道感染，如扁桃体炎等，多由A组β溶血性链球菌感染引起。研究表明，链球菌感染后，机体可产生免疫反应，形成免疫复合物，沉积在肾小球部位，引发肾小球的炎症反应，进而可能导致隐匿性肾小球肾炎的发生。一般在链球菌感染后1-3周左右，患儿可能出现隐匿性肾小球肾炎相关表现。儿童由于免疫系统发育尚未完全成熟，相对更容易受到链球菌等病原体的侵袭，且感染后免疫反应的调节可能相对不完善，增加了患病风险。
其他细菌或病毒感染：如葡萄球菌、肺炎球菌等细菌感染，以及EB病毒、巨细胞病毒等病毒感染，也可能与儿童隐匿性肾小球肾炎的发病存在一定关联。这些病原体感染人体后，同样可能通过免疫机制诱发肾小球的损伤，但相对链球菌感染而言，其具体的致病机制和关联程度在研究中相对链球菌感染稍显复杂，需要进一步深入探究其免疫反应的具体过程和特点。
免疫因素：
自身免疫紊乱：儿童自身免疫系统在发育过程中可能出现暂时性的紊乱情况。例如，机体的免疫识别功能出现异常，不能准确识别自身组织和外来病原体，导致免疫系统错误地攻击肾小球组织。这种自身免疫紊乱可能是多因素引起的，包括遗传易感性、环境因素等综合作用。遗传因素在其中起到一定作用，若家族中有自身免疫性疾病的病史，儿童患隐匿性肾小球肾炎的风险可能会有所增加。环境中的某些因素，如长期接触某些化学物质、处于特殊的生活环境等，可能会诱发自身免疫紊乱的发生。
免疫复合物沉积：除了感染相关的免疫复合物形成外，自身免疫反应产生的免疫复合物也可能沉积在肾小球。这些免疫复合物沉积在肾小球基底膜等部位，激活补体系统，引起炎症反应，损伤肾小球结构和功能，从而导致隐匿性肾小球肾炎。免疫复合物的大小、性质等因素会影响其在肾小球内的沉积部位和程度，进而影响病情的发展和严重程度。
遗传因素：部分儿童隐匿性肾小球肾炎可能与遗传因素有关。一些研究发现，某些特定的基因变异可能增加儿童患隐匿性肾小球肾炎的易感性。例如，与肾小球滤过屏障相关的基因发生突变或多态性改变时，可能影响肾小球的正常结构和功能，使儿童更容易受到各种致病因素的影响而发病。但遗传因素并非是单一决定因素，通常是在遗传易感性的基础上，结合环境等其他因素才会导致疾病的发生。不同的遗传背景在不同的生活环境下，对儿童隐匿性肾小球肾炎的发病影响程度不同，需要综合考虑遗传和环境等多方面因素来评估个体的患病风险。
其他因素：
过敏因素：儿童如果存在过敏体质，接触过敏原后可能诱发免疫反应，累及肾小球。例如，对某些食物（如鱼虾、牛奶等）、药物（如青霉素等）或花粉等过敏原过敏时，机体的免疫反应可能波及肾小球，导致肾小球的炎症损伤，进而引发隐匿性肾小球肾炎。过敏因素导致的发病机制与免疫复合物形成等免疫反应相关，过敏体质的儿童在接触过敏原后，免疫系统被激活，产生相应的免疫应答，引起肾小球的病理改变。
劳累因素：儿童如果过度劳累，可能会影响机体的免疫功能和整体健康状况，使身体的抵抗力下降，从而增加患病的风险。长期的劳累可能导致儿童的生物钟紊乱、代谢失衡等，进而影响肾小球的正常生理功能，使肾小球更容易受到各种致病因素的侵袭而发生炎症反应。对于正处于生长发育阶段的儿童来说，合理安排作息时间，避免过度劳累，对于维持身体健康、预防隐匿性肾小球肾炎等疾病具有重要意义。
