疱疹性咽峡炎由肠道病毒引起，常见致病肠道病毒有柯萨奇病毒A组部分型和肠道病毒71型等，传播途径包括粪-口途径和呼吸道飞沫传播，5岁以下儿童易感，发病机制是病毒经口、鼻进入人体增殖、形成病毒血症，在咽部等部位引起病变和发热等症状
传播途径
粪-口途径：肠道病毒可通过被污染的食物、水等经口传播。例如，儿童在玩耍过程中接触了被污染的玩具，然后将手放入口中，就可能感染肠道病毒引发疱疹性咽峡炎。在一些卫生条件较差、水源可能被污染的地区，这种传播方式更为常见。
呼吸道飞沫传播：患者咽喉部排出的含有病毒的飞沫，可通过空气传播给他人。当健康人吸入含有病毒的飞沫后，病毒就有可能在其体内定植并引发感染。在幼儿园、学校等人员密集的场所，这种呼吸道飞沫传播的风险较高，因为人员之间距离较近，飞沫容易在人群中传播。
易感人群及发病机制
易感人群：儿童尤其是5岁以下儿童较为易感。这是因为儿童的免疫系统相对尚未完全发育成熟，对肠道病毒的抵抗力较弱。随着年龄增长，人体免疫系统逐渐完善，感染的几率会相对降低。但在某些情况下，如儿童生活环境拥挤、卫生状况不佳等，即使年龄稍大的儿童也可能感染。
发病机制：肠道病毒经口、鼻进入人体后，在咽部和肠道黏膜上皮细胞等部位增殖，然后侵入局部淋巴结等组织，随后进入血液循环形成病毒血症。病毒随血液循环到达全身各个组织器官，包括咽部等部位，在这些部位引起细胞病变，导致咽峡部出现疱疹、溃疡等病变，同时引发发热等全身症状。例如，柯萨奇病毒A组病毒感染人体后，会在咽峡部的黏膜细胞内大量复制，破坏细胞结构，引起炎症反应，表现为咽峡部的疱疹和溃疡，并且刺激机体的免疫反应，导致体温调节中枢紊乱，出现发热症状。
