疱疹性咽峡炎发烧时长个体有差异，一般多数患儿持续2-4天，受年龄、病毒毒力、自身免疫状况影响，婴幼儿发烧可能稍长，年长儿稍短，毒力强、自身免疫差者发烧更久，婴幼儿需密切监测体温、及时就医，免疫力低下儿童要细致护理、遵医嘱治疗。
影响发烧时长的因素
年龄因素：
婴幼儿由于免疫系统发育尚不完善，感染疱疹性咽峡炎后可能发烧时间相对稍长一些。例如，6个月-3岁的婴幼儿感染后，身体对病毒的反应和调节能力相对较弱，可能发烧持续3-4天甚至更久。
年长儿童免疫系统相对更成熟，发烧持续时间可能相对短些，多数在2-3天左右。
病毒毒力：不同亚型的肠道病毒毒力不同，毒力较强的病毒感染引起的疱疹性咽峡炎，患儿发烧持续时间可能会稍长，一般可能达到3-4天甚至更久；而毒力较弱的病毒感染引起的，发烧持续时间可能在2-3天。
自身免疫状况：本身免疫力较好的患儿，感染疱疹性咽峡炎后，身体能够较快地启动免疫反应来对抗病毒，发烧持续时间相对较短，可能2-3天体温就能逐渐恢复正常；而本身免疫力低下的患儿，如患有先天性免疫缺陷病的儿童，感染后发烧持续时间可能会延长，可能超过4天甚至更久。
特殊人群注意事项
婴幼儿：由于婴幼儿体温调节中枢发育不完善，发烧时需密切监测体温变化，体温超过38.5℃且精神状态不佳时，可采用适当的物理降温，如用温水擦拭额头、颈部、腋窝、腹股沟等部位，但要避免擦拭胸部、腹部等敏感部位，同时要及时就医，因为婴幼儿病情变化较快，需由医生评估病情并给予相应处理。
免疫力低下儿童：这类儿童感染疱疹性咽峡炎后发烧持续时间可能较长，家长要更加细致地护理，除了密切监测体温外，要保证患儿充足的休息，提供营养丰富的饮食，以增强机体抵抗力，并且要严格遵循医生的治疗方案，按时复诊，以便医生根据病情变化调整治疗措施。
