婴儿肠套叠的发生与多种因素有关，包括肠道解剖因素（婴儿期回盲部系膜未完全固定、活动度大，多见于4-10个月婴儿）、病毒感染因素（轮状病毒等感染致末端回肠集合淋巴结增生等，6-24个月婴儿相关）、饮食改变因素（添加辅食阶段饮食变化致肠道功能紊乱，4-12个月婴儿辅食添加时需关注）和遗传因素（部分肠套叠与遗传易感性有关，家族有病史婴儿风险增加需密切观察）。
一、肠道解剖因素
婴儿期回盲部系膜尚未完全固定，活动度较大，这是导致肠套叠的一个重要解剖学基础。例如，当婴儿腹部受到轻微刺激或存在某些生理变化时，回盲部容易发生位置变动，从而增加肠套叠的发生风险。一般多见于4-10个月的婴儿，此阶段婴儿回盲部的这种解剖特点相对更为明显。
二、病毒感染因素
轮状病毒等感染可能引起末端回肠集合淋巴结增生，使肠壁增厚，甚至形成肿物突入肠腔，成为诱发肠套叠的起点。研究发现，在肠套叠患儿中，轮状病毒感染的检出率相对较高。该因素在6-24个月的婴儿中可能更为相关，因为这个年龄段的婴儿免疫系统相对尚未完全成熟，更容易受到病毒感染的影响。
三、饮食改变因素
婴儿在添加辅食的阶段，饮食性质和规律发生变化，可能导致肠道功能紊乱，进而引发肠套叠。比如从单纯的母乳或配方奶喂养过渡到添加固体食物时，肠道对新食物的适应过程中可能出现不协调，引起肠蠕动节律紊乱。这种情况在开始添加辅食后的婴儿中较为常见，一般在4-12个月的婴儿辅食添加过程中需重点关注。
四、遗传因素
虽然遗传因素导致婴儿肠套叠的具体机制尚不十分明确，但有研究提示部分肠套叠可能与遗传易感性有关。如果家族中有过婴儿肠套叠的病史，那么相关婴儿发生肠套叠的风险可能相对增加。对于有家族遗传倾向的婴儿，家长需要更加密切地观察婴儿的肠道功能和腹部情况，一旦出现异常表现要及时就医。
