孕酮低及怀孕困难可能由内分泌、子宫、其他等多因素引起，内分泌因素包括黄体功能不全及下丘脑-垂体-卵巢轴调节异常；子宫因素有子宫内膜异常及子宫发育不良；其他因素涉及遗传、生活方式及免疫等方面，不同因素在不同年龄段女性中有不同表现及影响。
一、内分泌因素
1.黄体功能不全：女性卵巢中的黄体是在排卵后形成的，其主要功能是分泌孕酮。如果黄体功能不全，就会导致孕酮分泌不足。正常情况下，黄体期一般持续约14天，在这个阶段，黄体应持续分泌足够量的孕酮来支持子宫内膜的转化，以利于受精卵着床和早期妊娠的维持。研究表明，约有30%-40%的反复孕酮低且怀孕困难的患者与黄体功能不全有关，该病症在有过多次不良妊娠史的女性中更为常见，年龄偏大（35岁以上）的女性发生黄体功能不全的概率相对更高，因为随着年龄增长，卵巢功能逐渐衰退，黄体形成和功能维持的能力下降。
2.下丘脑-垂体-卵巢轴调节异常：下丘脑分泌促性腺激素释放激素，刺激垂体分泌促卵泡生成素和促黄体生成素，进而调节卵巢的排卵和激素分泌功能。如果这个调节轴出现异常，比如下丘脑分泌激素的节律或量发生改变，或者垂体对下丘脑激素的反应异常，都会影响卵巢分泌孕酮的水平。青春期女性由于下丘脑-垂体-卵巢轴尚未完全成熟，可能会出现暂时性的孕酮低情况；而一些长期精神压力大、过度节食或患有某些内分泌疾病（如甲状腺功能异常）的女性，也可能因该调节轴紊乱导致孕酮分泌异常，这类女性中不同年龄段都可能出现，尤其是长期处于高压力状态下的20-40岁育龄女性更为多见。
二、子宫因素
1.子宫内膜异常：子宫内膜的容受性对于胚胎着床和维持妊娠至关重要，而孕酮可以促进子宫内膜的蜕膜化，为胚胎着床创造良好条件。如果子宫内膜存在病变，如子宫内膜炎、子宫内膜息肉、子宫内膜粘连等，会影响子宫内膜对孕酮的反应性，即使有一定量的孕酮，也无法正常发挥作用来支持胚胎着床和妊娠维持，从而导致孕酮相对不足。患有子宫内膜炎的女性，各个年龄段都可能发生，尤其是有宫腔操作史（如人工流产、清宫术等）的女性风险更高；子宫内膜息肉好发于30-50岁的女性，这些女性出现每次怀孕孕酮低的概率相对增加，因为息肉可能会影响子宫内膜的正常结构和功能。
2.子宫发育不良：一些女性存在先天性子宫发育不良的情况，如幼稚子宫，其子宫体积较小，子宫内膜的厚度和容受性可能都不理想，会影响孕酮对子宫内膜的作用效果，导致怀孕后孕酮分泌相对不足。这种情况在青春期女性中可能被发现，因为青春期女性子宫发育情况可通过妇科检查等初步评估，而对于已经过了青春期但存在怀孕后孕酮低问题的女性，也需要考虑子宫发育不良的可能。
三、其他因素
1.遗传因素：某些遗传基因突变可能会影响孕酮合成相关酶的活性，从而导致孕酮合成障碍。例如，与孕酮合成过程中关键酶相关的基因发生突变，就可能使孕酮分泌量减少。这类遗传因素导致的孕酮低具有一定的家族聚集性，在有家族遗传病史的人群中需要重点考虑，比如家族中有女性反复出现怀孕后孕酮低且不良妊娠结局的情况，就需要排查是否存在相关遗传因素。
2.生活方式因素：长期熬夜、过度吸烟饮酒等不良生活方式可能会影响内分泌系统的正常功能，进而影响孕酮的分泌。经常熬夜会打乱人体的生物钟，影响下丘脑-垂体-卵巢轴的正常调节；吸烟饮酒会对卵巢功能产生不良影响，干扰孕酮的合成和分泌。这类因素在年轻的育龄女性中较为常见，尤其是那些经常熬夜加班、社交活动中大量吸烟饮酒的女性，发生每次怀孕孕酮低的风险相对较高。
3.免疫因素：自身免疫性疾病可能会影响孕酮的分泌和作用。例如，抗磷脂综合征等自身免疫性疾病，患者体内存在自身抗体，可能会攻击与孕酮分泌或作用相关的组织或细胞，导致孕酮水平异常。患有自身免疫性疾病的女性，各个年龄段都可能出现，尤其是本身有免疫性疾病病史或家族中有自身免疫性疾病患者的女性，在怀孕后更易出现孕酮低的情况，需要密切监测孕酮水平并进行相应的免疫相关检查和处理。
