不孕不育的原因包括女性方面的排卵障碍、输卵管因素、子宫因素、免疫因素；男性方面的精子异常、输精管道梗阻、性功能障碍；以及男女双方共同的免疫因素、生活方式因素、年龄因素和不明原因不孕，其中女性排卵障碍患病率约6%-20%，输卵管因素致不孕占1/3左右，精索静脉曲张致男性不育占40%-50%，不良生活方式、年龄增长及不明原因也会影响生育。
一、女性方面的原因
1.排卵障碍：正常的排卵是怀孕的关键环节之一。多种因素可导致排卵障碍，例如多囊卵巢综合征，这是一种常见的妇科内分泌疾病，患者体内激素失衡，表现为雄激素水平升高、排卵稀发或不排卵等，据相关流行病学调查，其在育龄女性中的患病率约为6%-20%；下丘脑功能异常也会影响排卵，像过度节食、精神压力过大等都可能干扰下丘脑分泌促性腺激素释放激素，从而影响垂体分泌促性腺激素，进而导致排卵异常。
2.输卵管因素：输卵管起到拾取卵子、输送受精卵的重要作用。输卵管堵塞或粘连是常见的输卵管问题，多由盆腔炎症引起，比如盆腔炎未得到及时有效的治疗，炎症蔓延至输卵管，导致输卵管结构破坏、功能受损，据统计，因输卵管因素导致不孕的占女性不孕因素的1/3左右。此外，输卵管发育不良也可能影响其正常功能。
3.子宫因素：子宫是孕育胎儿的场所，子宫畸形、子宫肌瘤、子宫内膜异位症等都可能影响怀孕。子宫畸形如纵隔子宫等会改变宫腔形态，影响胚胎着床；子宫肌瘤如果生长在黏膜下或体积较大，会影响宫腔环境及胚胎种植；子宫内膜异位症会导致盆腔内环境改变，影响卵子、精子的结合以及受精卵的着床。
4.免疫因素：女性体内的免疫因素异常也可能导致不孕。例如抗精子抗体阳性，当女性生殖道黏膜受损时，精子进入体内可刺激免疫系统产生抗精子抗体，抗体与精子结合后会影响精子的活力和受精能力；还有抗子宫内膜抗体等，也会干扰胚胎的着床过程。
二、男性方面的原因
1.精子异常：精子数量不足、精子活力低下或精子畸形率过高都可能导致不育。精子数量方面，正常精子密度应大于15×10/ml，低于此值可能为少精子症；精子活力方面，精子前向运动的比例应大于32%，若低于此值则为弱精子症；精子畸形率正常应小于96%，过高的畸形率会影响精子的受精能力。导致精子异常的原因有很多，如长期接触放射性物质、高温环境、吸烟酗酒、某些疾病（如精索静脉曲张等）。精索静脉曲张可使睾丸局部温度升高，影响精子的生成和发育，据研究，约有40%-50%的男性不育患者存在精索静脉曲张。
2.输精管道梗阻：输精管道包括附睾、输精管等，任何部位的梗阻都可能阻止精子的排出。先天性的输精管道梗阻较为少见，后天性多由附睾炎、前列腺炎等疾病引起，炎症导致输精管道粘连、堵塞，使精子无法正常排出。
3.性功能障碍：如勃起功能障碍、早泄等，会影响精子进入女性生殖道，从而导致不孕。例如勃起功能障碍患者无法正常完成性交，精子无法进入阴道；早泄患者可能在精子尚未进入阴道时就已射精，影响受孕。
三、男女双方共同因素
1.免疫因素：除了女性体内的免疫因素外，男性自身的免疫因素也可能影响生育。例如男性抗精子抗体阳性，抗体可抑制精子的活动能力，影响精子与卵子的结合。
2.生活方式因素：不良的生活方式对生育有较大影响。长期熬夜会打乱人体的生物钟，影响内分泌系统的正常功能，进而影响排卵和精子的生成；过度肥胖会导致体内激素失衡，增加多囊卵巢综合征等疾病的发生风险，同时也会影响男性精子的质量；吸烟酗酒会损害生殖细胞，降低精子和卵子的质量，增加流产、胎儿畸形等风险。
3.年龄因素：女性的生育能力随着年龄的增长而逐渐下降，35岁以后生育能力下降较为明显，这与卵子的数量和质量下降有关；男性随着年龄增长，精子的数量和质量也会逐渐降低，40岁以后生育能力也会有所下降。
4.不明原因不孕：约有10%-15%的夫妇经过详细检查后仍找不到明确的不孕原因，被称为不明原因不孕，其具体机制尚不十分清楚，可能与潜在的免疫因素、卵子质量异常、胚胎着床障碍等多种因素有关。
