移植囊胚着床失败表现多样，有少量阴道出血、预期时间正常来月经、无明显症状以及激素水平异常（hCG不按正常妊娠翻倍增长甚至下降），不同年龄女性及有不同生活方式、病史的女性表现有差异。
阴道出血：部分女性可能会出现少量阴道出血，通常是点滴状的，颜色可能为粉红色或褐色。这是因为囊胚着床失败后，子宫内膜会有少量脱落出血。例如，相关研究发现，约有一定比例的移植囊胚着床失败女性会出现这种少量阴道出血情况，但具体比例会因不同研究人群等因素有所差异。
月经来潮：若囊胚着床失败，体内激素水平会发生变化，一般在移植后的预期来月经时间，会正常出现月经来潮。月经可能和平时的月经相似，也可能在经量、经期等方面与以往略有不同，但总体符合正常月经的周期及性状特点。
没有明显症状：有些女性移植囊胚着床失败时可能没有明显的自觉症状，自己难以察觉到异常，往往是通过再次检查发现囊胚未着床。这种情况在一些身体状况较好、对激素变化不敏感的女性中可能出现。
激素水平变化：通过检测激素水平可以发现，人绒毛膜促性腺激素（hCG）水平不会像正常着床妊娠那样持续上升。正常着床后hCG会隔日翻倍增长，而着床失败时hCG水平可能较低且不会呈现正常的翻倍趋势，甚至可能逐渐下降。对于有过移植经历且关注自身健康的女性，定期监测激素水平有助于及时发现着床失败情况。
对于不同年龄的女性，年龄较大的女性可能身体各方面机能相对较弱，着床失败后身体的反应可能相对不典型；年轻女性可能身体恢复相对较快，但激素变化等表现仍遵循上述一般规律。在生活方式方面，有不良生活方式如吸烟、酗酒等的女性，着床失败后身体的恢复和相关表现可能会受到一定不良影响，需要在日后注意调整生活方式。有过相关病史的女性，如曾有子宫疾病等病史，着床失败后的表现可能会更复杂，需要结合病史进一步评估和处理。
