查胚胎染色体有重要意义，可评估胚胎质量，明确胚胎是否存染色体数目或结构异常，助于发现异常胚胎避免不良妊娠；是辅助生殖技术选择依据，能为反复种植失败等患者调整治疗方案，为生育决策提供依据；可降低遗传疾病传递风险，夫妻有染色体异常携带或家族有遗传病史时能检测胚胎是否继承异常染色体，助选健康胚胎移植，有过染色体异常患儿出生史夫妇再妊娠时检查必要。
评估胚胎质量：通过对胚胎染色体进行检测，可以明确胚胎是否存在染色体数目异常（如21-三体、18-三体等常见的非整倍体异常）或结构异常。正常的胚胎染色体对于胚胎的正常发育至关重要，异常的染色体可能导致胚胎发育停止、流产、胎儿畸形等情况。例如，唐氏综合征就是由于21号染色体多了一条导致的，通过胚胎染色体检查可以在早期发现这种异常胚胎，避免不良妊娠结局。对于年龄较大的女性，随着年龄增长，卵子质量下降，胚胎染色体异常的概率增加，此时进行胚胎染色体检查尤为重要，因为这类女性自然受孕后发生染色体异常妊娠的风险较高。
辅助生殖技术的选择依据：在辅助生殖领域，如试管婴儿过程中，胚胎染色体检查可以为医生和患者提供重要参考。对于反复种植失败、反复流产的患者，进行胚胎染色体检查有助于找出胚胎方面的原因。如果发现胚胎存在染色体异常，医生可以根据具体情况调整治疗方案，比如考虑更换胚胎进行移植等。对于男性长期接触有害物质、生活方式不健康（如长期吸烟、酗酒等）的人群，其精子质量可能受到影响，进而影响胚胎染色体情况，通过胚胎染色体检查可以更好地了解胚胎的健康状况，为生育决策提供科学依据。
降低遗传疾病传递风险：如果夫妻双方存在染色体异常携带情况，或者有家族遗传病史，胚胎染色体检查能够检测出胚胎是否继承了异常的染色体，从而帮助夫妻选择健康的胚胎进行移植，降低将遗传疾病传递给下一代的风险。例如，夫妻一方是平衡易位携带者，通过胚胎染色体检查可以筛选出不携带异常平衡易位的胚胎进行移植，提高妊娠成功且胎儿健康的概率。对于有过染色体异常患儿出生史的夫妇，再次妊娠时进行胚胎染色体检查是必要的，因为他们再次发生染色体异常妊娠的风险比正常人群高很多，通过检查可以提前发现问题并采取相应措施。
