习惯性流产受多种因素影响，遗传因素方面夫妻双方染色体数目或结构异常可遗传给胚胎致流产，年龄大夫妇更常见；解剖因素包括子宫畸形、黏膜下肌瘤、宫腔粘连等影响胚胎着床发育环境；内分泌因素有黄体功能不全使孕激素不足、甲状腺功能异常干扰妊娠；免疫因素包含自身免疫性疾病致胚胎受损及同种免疫异常致母体攻击胚胎；感染因素是生殖道病原体感染引起子宫内膜炎症影响胚胎；血栓前状态因易栓倾向致胎盘血液循环受阻引发流产。
解剖因素
子宫解剖结构异常：如子宫畸形，像单角子宫、双角子宫、纵隔子宫等，子宫的形态异常会影响胚胎的着床和发育环境。子宫黏膜下肌瘤可改变宫腔内的环境，阻碍胚胎的正常生长；宫腔粘连也会影响子宫腔的容积，使胚胎着床受限，增加流产风险。这些解剖结构的异常在育龄女性中都可能存在，且不同的子宫畸形类型对流产的影响程度有所不同。
内分泌因素
黄体功能不全：黄体分泌的孕激素对维持妊娠至关重要。如果黄体功能不全，孕激素分泌不足，不能为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，就容易导致流产。在有过习惯性流产病史的女性中，黄体功能不全的发生率相对较高。
甲状腺功能异常：甲状腺功能减退或亢进都可能影响妊娠。甲状腺功能减退时，机体内分泌紊乱，会影响胚胎的生长发育；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会干扰妊娠过程，增加流产的可能性。这种内分泌异常在不同年龄段的女性中均可发生，尤其需要关注甲状腺功能的监测。
免疫因素
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，患者体内存在自身抗体，这些抗体可通过影响胎盘的血液循环等途径，导致胚胎受损，引发流产。自身免疫性疾病的发生与遗传、环境等多种因素相关，不同年龄段的患者都可能受到影响。
同种免疫异常：母体对胚胎的免疫耐受失衡，使得母体免疫系统将胚胎视为异物进行攻击，从而导致流产。这种免疫异常在反复发生习惯性流产的女性中较为常见，其具体的免疫机制较为复杂，涉及多种免疫细胞和细胞因子的参与。
感染因素
生殖道感染：某些病原体感染生殖道，如支原体、衣原体、细菌、病毒等。这些病原体感染可引起子宫内膜炎症，影响胚胎的着床和发育，导致流产。例如，支原体感染在育龄女性中并不少见，尤其是有不洁性生活史或多个性伴侣的女性更容易感染，进而增加习惯性流产的风险。
血栓前状态
体内存在易栓倾向，导致血液高凝状态，影响胎盘的血液循环，使胎盘缺血缺氧，从而引发流产。常见的易栓因素包括抗磷脂抗体综合征等，该综合征可导致胎盘血管内形成血栓，阻碍胎盘的血液供应，对胚胎的生长发育产生不利影响，这种情况在不同年龄和性别的人群中都可能出现。
