功能性胃肠病的治疗包括一般治疗、药物治疗及针对不同人群的特殊考虑和中医相关治疗。一般治疗需建立良好生活习惯、保持心理舒畅；药物治疗依症状选药且循证；儿童优先非药物干预、关注生活规律；老年人注意药物相互作用、坚持非药物干预；女性特殊时期注意生活护理、加强心理关怀；部分中医治疗经验证有效但需专业中医师据个体情况制定方案。
一、一般治疗
功能性胃肠病患者需建立良好生活习惯，避免烟、酒及服用非甾体抗炎药。注意根据年龄调整生活方式，如儿童应保证规律作息与合理饮食结构；老年人则需适度运动且避免过度劳累。保持心理舒畅，压力过大可能加重病情，可通过心理疏导等方式缓解，尤其女性可能因情绪波动更易受功能性胃肠病影响，需特别关注其心理状态。
二、药物治疗
根据不同症状选择药物，如存在反酸、烧心等症状可使用抑酸剂；有腹胀、早饱等消化不良症状可使用促胃肠动力药等，但药物使用需基于科学研究支持，严格遵循循证医学依据，选择经过临床验证有效的药物。
三、针对不同人群的特殊考虑
（一）儿童
儿童功能性胃肠病需格外谨慎用药，优先采用非药物干预，如调整饮食结构，保证食物多样化且易于消化，避免食用可能引起不适的食物。关注儿童生活规律，保证充足睡眠，因其处于生长发育阶段，不良生活方式对其影响更显著。
（二）老年人
老年人功能性胃肠病常伴随其他基础疾病，用药时需考虑药物相互作用。治疗中更注重非药物干预的长期坚持，如适度的温和运动、规律的少食多餐饮食方式等，以提高生活质量，同时密切关注其身体反应，及时调整治疗方案。
（三）女性
女性功能性胃肠病患者在生理期等特殊时期可能症状有所变化，需注意生理期的生活护理，如避免受寒等。在心理方面，女性可能因生理期激素变化等因素情绪波动较大，需加强心理关怀，辅助治疗功能性胃肠病。
四、中医相关治疗（基于循证医学认可部分）
部分中医治疗方法经临床研究验证对功能性胃肠病有一定效果，如某些中药方剂或中医推拿等，但需在专业中医师指导下进行，要确保其安全性与有效性符合循证医学要求，根据患者个体情况，如年龄、体质等制定合适的中医治疗方案。
