枕神经痛的原因包括神经源性和非神经源性因素。神经源性因素有神经受压（颈椎病变如骨质增生、椎间盘突出、颈椎管狭窄及肿瘤侵犯枕神经）和神经炎症（带状疱疹病毒等感染引发神经炎症）；非神经源性因素包括颈部肌肉劳损（长期不良姿势、外伤后肌肉恢复不良）和全身性疾病相关（风湿性疾病累及颈部关节周围组织、内分泌紊乱影响颈部组织功能）。
一、神经源性因素
（一）神经受压
1.颈椎病变相关
颈椎的退行性改变，如颈椎骨质增生、椎间盘突出等，可压迫枕神经。随着年龄增长，颈椎的椎间盘会逐渐发生退变，水分减少，弹性降低，容易向后突出，当突出的椎间盘压迫到走行于颈椎附近的枕神经时，就会引发枕神经痛。在长期伏案工作、颈部姿势不良的人群中，由于颈部肌肉紧张，颈椎力学平衡失调，更易加速颈椎的退变进程，从而增加枕神经受压的风险。
颈椎管狭窄也可能导致枕神经受压。颈椎管狭窄会使椎管内的空间变小，枕神经在椎管内走行时受到空间限制，神经传导受到影响，进而引发疼痛。一些先天性颈椎管狭窄的人群，或者因后天因素导致颈椎管逐渐狭窄的人群，都可能出现这种情况。
2.肿瘤相关
颅内或颈部的肿瘤可能侵犯枕神经。例如，颅内的肿瘤如果生长位置靠近枕神经走行区域，会直接压迫或浸润枕神经，导致神经功能异常，引发枕神经痛。颈部的肿瘤，如神经鞘瘤等，也可能对枕神经造成压迫或侵犯，影响神经的正常传导，引起疼痛症状。
（二）神经炎症
1.病毒感染
带状疱疹病毒感染是常见的导致枕神经炎症的原因。当人体免疫力下降时，潜伏在体内的带状疱疹病毒可被激活，侵犯枕神经，引起神经炎症反应。临床上常可见到患者在枕神经分布区域出现疱疹的同时伴有枕神经痛，这是因为病毒感染导致神经发生炎症，神经的敏感性增高，从而引发疼痛。例如，在一些劳累、患有其他基础疾病导致免疫力低下的人群中，更容易发生带状疱疹病毒对枕神经的侵犯。
其他病毒感染，如流感病毒等，也可能通过免疫反应间接引起枕神经的炎症。病毒感染后，机体的免疫系统被激活，产生的免疫反应可能波及到枕神经，导致神经炎症，进而引发枕神经痛。不过相对来说，带状疱疹病毒感染引起枕神经炎症导致枕神经痛的情况更为常见和典型。
二、非神经源性因素
（一）颈部肌肉劳损
1.长期不良姿势
长期低头工作、使用电子设备等不良姿势是导致颈部肌肉劳损的常见原因。长时间低头时，颈部肌肉处于持续紧张状态，会引起颈部肌肉的疲劳、痉挛，进而影响颈部的力学平衡，导致颈椎的力学结构发生改变，如颈椎生理曲度变直等，这种改变会对枕神经产生刺激或压迫，从而引发枕神经痛。例如，长时间低头看手机的人群，颈部肌肉长期处于紧张收缩状态，很容易出现颈部肌肉劳损，进而增加枕神经痛的发生风险。
睡眠姿势不当也可导致颈部肌肉劳损。不合适的枕头高度或睡眠姿势，会使颈部肌肉在睡眠中不能得到充分放松，长期如此，也会引起颈部肌肉的劳损，影响颈部的正常结构和功能，对枕神经产生不良影响，引发枕神经痛。
2.外伤后肌肉恢复不良
颈部受到外伤后，如颈部的挫伤、扭伤等，如果肌肉恢复不良，可能会导致颈部肌肉的粘连、挛缩等情况。这些异常的肌肉状态会影响颈部的正常解剖结构，对枕神经造成牵拉或压迫，从而引发枕神经痛。例如，颈部外伤后没有得到规范的治疗和充分的康复，肌肉恢复不佳，就可能遗留枕神经痛的问题。
（二）全身性疾病相关
1.风湿性疾病
类风湿关节炎等风湿性疾病可能累及颈部的关节和周围组织，进而影响枕神经。类风湿关节炎是一种自身免疫性疾病，可导致关节的炎症、破坏，当累及颈椎关节时，会引起颈椎的病变，如颈椎的滑膜炎等，从而压迫或刺激枕神经，引发枕神经痛。这类患者往往还伴有其他关节的疼痛、肿胀等症状，且病情可能会随着风湿性疾病的活动而波动。在患有风湿性疾病的人群中，需要密切关注颈部及枕神经区域的症状，因为枕神经痛可能是风湿性疾病累及颈部的一种表现。
系统性红斑狼疮等其他风湿性疾病也可能通过免疫复合物沉积等机制影响颈部组织，导致枕神经痛。系统性红斑狼疮患者体内存在多种自身抗体，这些抗体可能沉积在颈部的血管、神经周围，引起炎症反应，从而影响枕神经的功能，引发疼痛。
2.内分泌紊乱
女性在更年期等内分泌紊乱时期，体内激素水平发生变化，可能会影响颈部的软组织代谢等，从而增加枕神经痛的发生风险。更年期女性雌激素水平下降，会导致身体的一系列生理变化，包括颈部软组织的营养代谢等可能受到影响，进而引起颈部肌肉、神经等组织的功能紊乱，引发枕神经痛。此外，甲状腺功能异常等内分泌疾病也可能与枕神经痛有关。甲状腺功能减退时，机体的代谢率降低，可能会引起颈部组织的水肿等改变，对枕神经产生压迫或刺激，导致枕神经痛；而甲状腺功能亢进时，机体的高代谢状态也可能影响颈部组织的正常功能，与枕神经痛的发生有一定关联。
