肾盂肾炎是上尿路感染，常见致病菌主要为革兰阴性杆菌，以大肠埃希菌最常见约占80%-90%，还有肺炎克雷伯菌、变形杆菌等常见革兰阴性杆菌及铜绿假单胞菌、肠球菌等少见致病菌，不同人群发病与致病菌感染风险不同，如女性因尿道短直易感染，免疫力低下人群、有泌尿系统相关情况患者感染风险高，不同特殊人群需注意相应预防措施降低发病风险。
其他常见革兰阴性杆菌
肺炎克雷伯菌：在住院患者、有基础疾病或接受过侵入性操作的患者中较为常见。该菌可通过污染的尿路器械或患者自身的肠道定植菌移位等途径引发肾盂肾炎，其在尿路中生长繁殖时，会引起尿路炎症反应，导致肾盂黏膜充血、水肿等病理改变。
变形杆菌：也是肾盂肾炎的常见致病菌之一，尤其在伴有尿路结石的患者中易滋生。变形杆菌具有尿素酶活性，能分解尿素产生氨，使尿液pH值升高，这种碱性环境有利于细菌生长，同时氨对尿路黏膜有刺激作用，可加重尿路炎症，促进结石形成等，进一步影响肾盂的正常功能。
少见致病菌
铜绿假单胞菌：多见于尿路器械检查后、长期留置导尿管或免疫功能低下的患者。铜绿假单胞菌具有多种毒力因子，如内毒素、外毒素等，可引起严重的尿路炎症反应，且该菌对多种抗生素易产生耐药性，给肾盂肾炎的治疗带来一定困难。
肠球菌：在女性肾盂肾炎中也有一定比例，尤其是老年女性或伴有泌尿系统结构异常的患者。肠球菌可通过尿道逆行感染或血行感染途径到达肾盂，其生长特性相对较特殊，在尿路中能形成生物膜，增加了治疗的难度，生物膜中的细菌不易被抗生素完全杀灭，容易导致感染复发。
对于不同年龄、性别和生活方式的人群，肾盂肾炎的发病与致病菌感染的风险有所不同。例如，女性由于尿道短而直，更容易发生大肠埃希菌等致病菌的逆行感染；长期卧床、糖尿病患者等免疫力低下人群，更易受到多种致病菌的侵袭引发肾盂肾炎。在病史方面，有泌尿系统结石、尿路梗阻、留置导尿管等情况的患者，其肾盂肾炎的致病菌感染风险更高，因为这些因素会破坏尿路的正常防御机制，为致病菌提供了良好的定植和繁殖环境。对于特殊人群如儿童，由于其泌尿系统发育尚未完全成熟，在预防肾盂肾炎时要注意保持外阴清洁，减少致病菌感染机会；对于老年患者，要密切关注其基础疾病，积极控制血糖、治疗尿路梗阻等，以降低肾盂肾炎的发病风险。
