真菌性鼻窦炎可破坏鼻窦骨质致面部畸形等局部损害，严重时可经血液循环播散至颅内、肺等脏器，还会引发鼻塞等症状影响生活质量，慢性迁延不愈会持续破坏组织致引流免疫受损形成恶性循环加重负担。
一、局部组织损害
真菌性鼻窦炎时，真菌在鼻窦内繁殖生长，可破坏鼻窦骨质，如侵蚀上颌窦、筛窦等窦壁骨质，导致骨质破坏，进而可能引起面部畸形，若侵犯眼眶可造成眼球突出、眼肌麻痹等，影响眼部正常结构与功能，例如真菌性鼻窦炎累及眼眶时，炎症可波及眼外肌，导致眼球运动受限，影响患者视物功能。不同年龄人群中，儿童骨骼发育尚不完善，骨质破坏可能对其面部发育等产生更长远影响；老年人骨质本身有退变，骨质破坏后恢复能力相对较弱。
二、全身播散风险
严重的真菌性鼻窦炎可出现真菌全身播散情况，真菌可经血液循环等途径播散至全身重要脏器。若播散至颅内，可引起真菌性脑膜炎，患者会出现发热、头痛、意识障碍等症状，病情严重时可危及生命；播散至肺部可导致肺真菌病，出现咳嗽、咯血、呼吸困难等表现。对于糖尿病患者，因其体内高血糖环境利于真菌生长繁殖，全身播散风险较一般人群更高；妊娠期女性由于机体免疫状态改变及激素水平影响，真菌播散后对自身及胎儿的影响更为复杂，可能影响胎儿发育等。
三、对生活质量的影响
患者会出现鼻塞、流涕、头痛、嗅觉减退等典型症状，长期鼻塞会导致呼吸不畅，影响睡眠质量，进而使患者白天精神萎靡，影响日常工作效率、学习状态等。例如长期鼻塞的患者在工作时易因呼吸问题注意力不集中，影响工作表现；儿童患者若长期受真菌性鼻窦炎困扰，可能影响其学习时的专注力及生长发育过程中的身心状态。
四、慢性迁延不愈的影响
慢性真菌性鼻窦炎可反复迁延不愈，持续破坏鼻窦组织，导致鼻窦正常的引流及免疫等功能长期受损。鼻窦正常引流功能受阻会使分泌物积聚，进一步加重炎症反应，形成恶性循环，长期如此会严重影响患者的生活质量，且增加后续治疗的难度，例如慢性真菌性鼻窦炎患者鼻窦内长期存在炎症，会反复出现症状复发，需要多次就医及治疗，给患者带来身体和心理上的双重负担。
