伤寒的主要并发症包括肠出血（多在病程2-3周，少量无症状，大量有相应表现）、肠穿孔（最严重，多在病程2-3周，右下腹剧痛等）、中毒性肝炎（多在病程1-2周，肝大等）、中毒性心肌炎（多见于病程2-3周，心率等异常）、支气管炎或支气管肺炎（多见于儿童及老年患者，因抵抗力下降继发感染）
肠出血：是伤寒较常见的严重并发症，多发生在病程第2-3周。肠道病变处坏死、溃疡累及血管导致出血，少量出血可无症状，大量出血时可出现体温骤降、头晕、心慌、血压下降等表现。年龄较小的儿童发生肠出血时可能因表达不清而被忽视，需密切观察其生命体征及粪便情况；对于有基础心血管疾病的患者，肠出血可能加重心脏负担，影响预后。
肠穿孔：为伤寒最严重的并发症，多发生于病程第2-3周，好发于回肠末段。常因肠壁坏死穿孔所致，患者突发右下腹剧痛，伴有恶心、呕吐、体温下降、脉搏加快、腹肌紧张等表现。儿童肠穿孔时症状可能不典型，容易延误诊断；老年患者发生肠穿孔后，机体反应可能较弱，病情进展可能较为隐匿。
中毒性肝炎：多发生在病程第1-2周，表现为肝大、压痛，血清丙氨酸氨基转移酶（ALT）升高等。其发生与伤寒杆菌的毒素作用有关，不同年龄人群的肝脏对毒素的耐受及反应可能不同，儿童肝脏相对娇嫩，更易受到影响；有基础肝脏疾病的患者发生中毒性肝炎时，可能加重肝脏损害。
中毒性心肌炎：多见于病程第2-3周，有严重毒血症的患者易发生。表现为心率加快、心音低钝、心律不齐等。儿童的心肌功能与成人有所不同，发生中毒性心肌炎时可能影响其生长发育；老年患者本身心脏功能可能有所减退，中毒性心肌炎会进一步增加心脏事件的风险。
支气管炎或支气管肺炎：多见于儿童及老年患者，常因机体抵抗力下降，继发肺炎链球菌或其他病原菌感染引起。儿童的呼吸道防御功能相对较弱，更容易发生呼吸道感染；老年患者呼吸道纤毛运动减弱等因素使其易受感染影响呼吸功能。
