缺铁性贫血会对血液系统、免疫系统、消化系统、神经系统产生多方面不良影响，如血液系统致全身供氧不足、影响心脏功能等；免疫系统致免疫力降低、易感染等；消化系统致食欲减退等；神经系统致儿童注意力不集中等、成人情绪不稳定等。
一、对血液系统的影响
长期缺铁性贫血会使红细胞内血红蛋白合成减少，红细胞携氧能力下降，导致全身组织器官供氧不足。患者会出现面色苍白、头晕、乏力等症状，且由于血液携氧能力降低，心脏需要更努力地工作来满足身体的氧需求，长期如此可能会影响心脏功能，增加心脏负担，引发心悸等不适。儿童长期缺铁性贫血还可能影响其生长发育过程中的造血功能及身体各器官的正常代谢，导致生长速度减慢等情况。
二、对免疫系统的影响
缺铁会影响免疫细胞的功能和数量。例如，淋巴细胞的增殖和活性会受到抑制，巨噬细胞的杀菌能力也会下降，使得机体的免疫力降低，更容易受到病原体的侵袭，表现为经常发生感染性疾病，如呼吸道感染等，且感染后恢复时间可能会延长。对于女性来说，长期缺铁性贫血可能会在一定程度上影响其生殖系统相关的免疫环境，增加妇科感染的风险；而儿童长期免疫功能受影响则会严重干扰其正常的生长发育过程中的防御机制。
三、对消化系统的影响
缺铁会影响消化系统的功能，患者可能出现食欲减退、腹胀、便秘等症状。因为铁参与胃肠道黏膜细胞的代谢，缺铁时胃肠道黏膜萎缩、胃酸分泌减少，进而影响食物的消化和吸收。长期如此会进一步加重营养缺乏的状况，形成恶性循环，影响整体健康状况。对于有基础胃肠道疾病病史的人群，长期缺铁性贫血可能会使原有的胃肠道症状加重，如胃溃疡患者可能因贫血导致病情恢复缓慢等。
四、对神经系统的影响
缺铁会影响神经系统的发育和功能。儿童长期缺铁性贫血可能出现注意力不集中、记忆力减退、学习能力下降等情况，因为铁是神经系统发育所需酶的重要组成成分，缺铁会影响神经髓鞘的形成等。成人长期缺铁性贫血也可能出现情绪不稳定、烦躁等神经系统功能紊乱的表现。女性在生理期时，由于铁的流失相对较多，若本身就有缺铁性贫血，神经系统受影响可能会更加明显，出现头晕、头痛等不适加重的情况。
