外阴营养不良确切病因未完全明确，可能与基因遗传、自身免疫、内分泌失调、局部刺激、慢性炎症等因素相关，基因遗传使个体易现外阴细胞代谢等异常；自身免疫紊乱致外阴组织细胞受损；内分泌失调影响外阴皮肤黏膜营养代谢；局部刺激致外阴皮肤黏膜损伤；慢性炎症长期刺激使外阴组织结构和功能受影响，进而引发外阴营养不良
基因遗传因素：有研究表明，部分外阴营养不良患者存在一定的家族遗传倾向，遗传因素可能使个体更容易发生外阴局部的细胞代谢、增殖等方面的异常，从而增加外阴营养不良的发病风险。例如某些基因的突变或异常表达，可能影响外阴皮肤黏膜的正常结构和功能维持。
自身免疫因素：自身免疫系统紊乱可能参与外阴营养不良的发生。机体的免疫系统错误地攻击外阴局部的组织细胞，导致组织细胞受损，进而影响外阴皮肤黏膜的正常生理状态。比如自身抗体可能针对外阴皮肤中的某些特定成分进行攻击，引发炎症反应等一系列病理过程，长期的炎症刺激可能导致外阴营养不良的出现。
内分泌失调因素：女性体内的内分泌状况对外阴皮肤黏膜的健康有重要影响。当内分泌失调时，如雌激素水平的变化，可能影响外阴皮肤黏膜的营养状况和代谢功能。例如绝经后女性雌激素水平下降，外阴皮肤黏膜失去了正常的雌激素支持，可能出现萎缩、弹性降低等改变，增加外阴营养不良的发生几率。
局部刺激因素：长期的局部刺激也是可能的诱因之一。如不注意外阴局部的清洁卫生，分泌物、尿液、粪便等长期刺激外阴；穿着不透气、化纤材质的内裤，导致外阴局部长期处于潮湿、不通风的环境；过度搔抓外阴等，这些因素都可能对外阴皮肤黏膜造成损伤，反复的损伤修复过程可能导致组织细胞的异常增生或退化，进而引发外阴营养不良。
慢性炎症因素：外阴部位的慢性炎症，如外阴炎反复发作，炎症长期刺激外阴皮肤黏膜，会影响其正常的组织结构和功能。炎症过程中释放的各种炎性介质会持续作用于外阴组织，导致细胞的代谢、增殖等发生紊乱，长期的慢性炎症刺激可能逐渐发展为外阴营养不良。例如一些患者有长期的外阴炎病史，在炎症未得到有效控制的情况下，逐渐出现外阴皮肤黏膜的色泽改变、质地异常等外阴营养不良的表现。
