怀孕两个月胎停原因包括胚胎染色体异常、母体内分泌失调（黄体功能不全、甲状腺功能异常）、自身免疫性疾病（抗磷脂综合征致胎盘血管血栓影响血供）、全身性疾病（未控糖尿病、严重高血压影响营养物质传递与血供）、感染因素（病毒通过胎盘干扰发育）、子宫解剖结构异常（畸形改变子宫环境）、生活方式因素（过量吸烟酗酒、长期接触有毒有害物质损害胚胎）及心理因素（长期精神压力大致激素失衡不利胚胎发育）。
一、胚胎因素
染色体异常是怀孕两个月胎停的重要原因，包括夫妻双方染色体数目或结构异常传递给胚胎，约50%-60%的早期胎停与胚胎染色体异常相关，如胚胎出现非整倍体等染色体数目异常情况，会影响胚胎正常发育进程，导致胎停发生。
二、母体因素
内分泌失调：黄体功能不全较为常见，会使孕激素分泌不足，无法为胚胎发育提供良好的激素环境，研究显示黄体功能不全女性胎停发生率高于正常人群；甲状腺功能异常也会影响，甲状腺功能减退或亢进均可干扰胚胎发育所需的内分泌平衡，从而增加胎停风险。
自身免疫性疾病：抗磷脂综合征是典型代表，体内存在的自身抗体可导致胎盘血管血栓形成，影响胎盘血供，使得胚胎营养供应受阻，引发胎停。
全身性疾病：母体患有严重全身性疾病，如未控制好的糖尿病，高血糖环境会影响胎盘微血管，阻碍营养物质传递；严重高血压会降低胎盘灌注压，影响胚胎血供，进而导致胎停。
感染因素：孕期感染风疹病毒、巨细胞病毒等，病毒可通过胎盘感染胚胎，干扰胚胎正常发育过程，引发胎停。
子宫解剖结构异常：子宫畸形，像纵隔子宫、单角子宫等，会改变子宫内环境，影响胚胎着床空间及后续发育，增加胎停几率。
三、生活方式因素
孕妇过量吸烟、酗酒，烟草中的尼古丁和酒精中的乙醇等有害物质会通过胎盘影响胚胎，干扰胚胎细胞分裂、分化等过程；长期接触有毒有害物质，如苯、甲醛等化学物质，也会对胚胎发育造成损害，增加胎停风险。
四、心理因素
长期精神压力过大，会使孕妇体内激素水平失衡，影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，进而对胚胎发育产生不利影响，增加胎停发生的可能性。
