骨结核有全身症状和局部症状，全身症状包括多数患者午后低热、部分伴夜间盗汗致消瘦，还有乏力、食欲减退；局部症状有病变部位疼痛（如脊柱、髋关节、膝关节结核疼痛表现不同）、肿胀（因炎症致液体渗出积聚）、功能障碍（脊柱结核活动受限、驼背，髋关节结核跛行，膝关节结核活动受限）、病情迁延不愈可形成窦道（有脓液流出、皮肤色素沉着瘢痕形成）。
乏力：患者会感觉全身没有力气，活动耐力明显降低，日常的简单活动就会让其感到疲惫不堪，这是因为结核杆菌在体内繁殖代谢，消耗机体能量，同时机体处于慢性消耗状态所致。
食欲减退：患者食欲下降，不想进食，摄入的营养物质减少，进一步加重身体的虚弱状态，儿童患者可能还会影响生长发育，因为生长发育需要充足的营养支持，而食欲减退导致营养摄入不足会阻碍正常的生长进程。
局部症状
疼痛
病变部位疼痛：骨结核病好发于脊柱、髋关节、膝关节等部位，以脊柱结核为例，患者最初可能仅感腰部疼痛，休息后可缓解，随着病情进展，疼痛会逐渐加重，且可沿神经根放射，如腰椎结核疼痛可放射至臀部、大腿部位；髋关节结核患者会感到腹股沟区疼痛，有时也会放射至膝关节，儿童患者往往不能准确表述疼痛部位，可能会表现为哭闹、不愿活动患肢等。
肿胀：病变部位可能会出现肿胀，如脊柱结核时椎旁可能形成寒性脓肿，表现在体表可触及肿块；髋关节结核时髋关节周围可能会有肿胀现象，肿胀的程度与病情的严重程度相关，肿胀是由于结核杆菌感染引起局部组织炎症反应，血管通透性增加，液体渗出积聚所致。
功能障碍
脊柱结核：患者脊柱活动受限，不能正常弯腰、扭转等，严重时会出现驼背畸形，这是因为脊柱骨质破坏，稳定性受到影响，为了减轻疼痛和保护病变部位，机体产生保护性反应，导致脊柱活动受限，长期可引起脊柱畸形。
髋关节结核：患者髋关节活动受限，行走困难，表现为跛行，这是由于髋关节疼痛、关节周围肌肉痉挛等原因导致，儿童患者还可能因为髋关节疼痛而出现步态异常。
膝关节结核：膝关节会出现肿胀、疼痛，导致患者膝关节活动受限，影响行走和日常活动，同样是因为结核杆菌感染引起膝关节局部炎症，刺激周围组织，导致关节功能障碍。
窦道形成：病情迁延不愈时，病变部位可能会形成窦道，有稀薄脓液流出，窦道周围皮肤可出现色素沉着、瘢痕形成等，窦道的形成是因为病变部位的脓肿穿破皮肤，结核杆菌不断排出，局部组织反复感染、修复，形成慢性窦道，增加了感染的风险，也不利于病情的恢复。
